RESUMO
Purpose: This study aims to demonstrate the possibility of detecting segmental uniparental isodisomy (iUPD) using a next-generation sequencing gene panel by reporting a Leber congenital amaurosis (LCA) case caused by a homozygous pathogenic variant in RPE65 (c.1022 T > C:p.Leu341Ser) inherited exclusively from the proband's mother.Methods: Samples from the trio (proband, mother, and father) were sequenced with a next-generation sequencing (NGS) retinopathy gene panel (224 genes) and the VCF file containing all variants was used in order to determine single nucleotide variant (SNV) counts from each sample across all chromosomes.Results: Trio analysis showed that of 81 Chr1 inherited variants 41 were exclusively maternal, including 21 homozygous. The other 40 variants were common to both parents. On remaining autosomal chromosomes (Chr2-22) 645 inherited variants were found, 147 of them were exclusively maternal and 132 exclusively paternal. Based on these NGS data, it was possible to note that the proband's chromosomes 1 are more similar to his mother's chromosome 1 than his father's, suggesting the pathogenic homozygous variant found in this patient was inherited exclusively from the mother due to uniparental maternal isodisomy.Conclusions: This study presents a secondary analysis pipeline to identify responsible variants for a phenotype and the correct inheritance pattern, which is a critical step to the proper and accurate genetic counseling of all family members. In addition, this approach could be used to determine iUPD in different Mendelian disorders if the sequencing panel identifies variants spread throughout the genome.
Assuntos
Cromossomos Humanos Par 1/genética , Amaurose Congênita de Leber/diagnóstico , Amaurose Congênita de Leber/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Distrofias Retinianas/genética , Dissomia Uniparental/genética , cis-trans-Isomerases/genética , Adulto , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Humanos , Masculino , Fenótipo , Distrofias Retinianas/diagnóstico , Sequenciamento do ExomaRESUMO
Estudamos citogeneticamente 48 pacientes de sexo masculino, casos isolados de distrofia muscular de Duchenne ou Becker. Todos apresentaram cromossomos X normais. Fragilidade da bandfa Xp21 foi investigada em 28 pacientes e somente uma célula apresentou quebra cromossômica nessa regiäo no total de 1400 células analisadas (0.07%). A baixa frequência de quebra exclue Xp21 como um sítio frágil nestes pacientes
Assuntos
Masculino , Fragilidade Cromossômica , Cromossomos , Citogenética , Distrofias Musculares/genéticaRESUMO
As Distrofias Musculares Progressivas caracterizam-se e säo classificadas de acordo com a hereditariedade. A forma pseudo-hipertrófica severa ou de Duchenne é transmitida por herança ligada ao cromossomo X, recessivo, manifestando-se somente em indivíduos masculinos. O presente caso mostra características clínicas e laboratoriais da forma de Duchenne em paciente do sexo feminino, sendo esta manifestaçäo explicada por uma translocaçäo cromossômica que afetou o cromossomo X e o autossomo 22
Assuntos
Criança , Humanos , Feminino , Distrofias Musculares/genética , Translocação GenéticaRESUMO
Realizamos estudo dermatoglífico de 8 pacientes com SPW e cariótipo normal, compreendendo as seguintes variáveis: padröes digitais e palmares, pregas palmares e terminaçöes das linhas principais, contagem total de cristas e índices de ulnaridade e da linha principal. A análise da freqüência de padröes digitais, pregas palmares e terminaçöes das linhas principais incluíu os dados da literatura referentes a 24 pacientes com SPW e cariótipo normal. Somente as terminaçöes das linhas principais A e T diferiram significantemente entre os pacientes e o grupo controle; a linha principal A terminou radialmente (posiçäo 1 + 2) mais frequentemente do que no controle e a linha principal T estava deslocada da posiçäo 13 para 11 ou 12 mais frequentemente nos pacientes do que no controle