RESUMO
The productivity of herds may be negatively affected by inbreeding depression, and it is important to know how intense is this effect on the livestock performance. We performed a comprehensive analysis involving five Zebu breeds reared in Brazil to estimate inbreeding depression in productive and reproductive traits. Inbreeding depression was estimated for 13 traits by including the individual inbreeding rate as a linear covariate in the standard genetic evaluation models. For all breeds and for almost all traits (no effect was observed on gestation length), the performance of the animals was compromised by an increase in inbreeding. The average inbreeding depression was -0.222% and -0.859% per 1% of inbreeding for linear regression coefficients scaled on the percentage of mean (ßm ) and standard deviation (ßσ ), respectively. The means for ßm (and ßσ ) were -0.269% (-1.202%) for weight/growth traits and -0.174% (-0.546%) for reproductive traits. Hence, inbreeding depression is more pronounced in weight/growth traits than in reproductive traits. These findings highlight the need for the management of inbreeding in the respective breeding programmes of the breeds studied here.
Assuntos
Bovinos/classificação , Bovinos/genética , Endogamia , Carne , Leite , Animais , Brasil , Bovinos/fisiologiaRESUMO
Records of 17,141 Nellore cattle participating in cattle championships, born from 1994-2009, were used to estimate genetic parameters between animal rank in cattle championships, evaluated from weaning to 36 months of age as repeated traits, and growth, fertility, and carcass traits, evaluated at 365 days of age as single traits. Two traits were defined for animal rank in cattle championships: value 1 was attributed to animals ranked from 1st to 3rd place within the age category, and value 0 was assigned to the remaining animals (TOP3). Value 1 was attributed to animals ranked from 1st to 5th place within the age category and value 0 was assigned to the remaining animals (TOP5). The (co)variance components were estimated based on Bayesian inference under a 2-trait threshold-linear animal model. The posterior means of heritability estimated for TOP3 and TOP5 were 0.182 ± 0.010 and 0.260 ± 0.012, respectively, and their repeatabilities were 0.341 ± 0.007 and 0.400 ± 0.007, respectively. High-ranking animals generally presented higher breeding values for body weight, height, body length, and heart girth. The phenotypic correlations indicate that judges of cattle championships primarily rank animals based on weight and heart girth.
Assuntos
Estudos de Associação Genética , Característica Quantitativa Herdável , Animais , Bovinos , FenótipoRESUMO
Zebu breeds play an important role in cattle production systems in Brazil. To assess the genetic variability from animals in the Herd Books of Nelore, Gir and Guzerat breeds, generation intervals, inbreeding, effective population size and parameters of gene origin (effective number of founders, ancestors and founder genomes) were calculated using pedigree records from 1938 to 1998. Breed subdivision was quantified by Wright's F-statistics. Calculations were separately carried out for consecutive 4-year intervals in the period 1979-98. Generation interval was around 8 years for the three breeds. Total inbreeding increased in all the breeds reaching values of 2.13%, 2.28% and 1.75%. Effective population size decreased from 85 to 68 in Nelore, from 70 to 45 in Gir and remained nearly constant around 104 in Guzerat. The quantities assessing the number of contributing ancestors decreased with time in all the breeds, and in the last analysed period the most important ancestor accounted for 14%, 3.1% and 4.1% in Nelore, Gir and Guzerat, respectively. Results indicate that the studied breeds are suffering from a loss of genetic variability which can result in negative effects on breeding and conservation purposes.
Assuntos
Bovinos/genética , Variação Genética , Genética Populacional , Endogamia , Linhagem , Animais , Brasil , Densidade DemográficaRESUMO
Descreveu-se a estrutura da populaçäo do rebanho Tabapuä registrado no Brasil. Foram geradas estatísticas descritivas da distribuiçäo do número de progênies e estimados o intervalo de geraçöes, estatísticas de F, número efetivo de fundadores, de ancestrais e de genomas remanescentes, além do tamanho efetivo da populaçäo, usando o registro genealógico de animais nascidos entre 1971-1998. Entre 1994 e 1998 foram registrados 37.778 animais, 18.736 machos e 19.042 fêmeas, pertencentes a 136 criadores. As médias dos intervalos de geraçöes estimadas para os períodos de 1979-1983, 1984-1988, 1989-1993 e 1994-1998 foram, respectivamente, 6,26; 7,18; 7,68 e 7,56 anos para pais-filhos e 6,18; 6,43; 6,99 e 7,27 para pais-pais. O tamanho efetivo da populaçäo e o número efetivo de fundadores, de ancestrais e de genomas remanescentes em cada um dos períodos foram, respectivamente, 378, 218, 213 e 181; 131, 254, 202 e 163; 73, 150, 119 e 94 e 55, 112, 78 e 61
Assuntos
Bovinos , Genética , Endogamia , PopulaçãoRESUMO
Descreveu-se a estrutura populacional da raça Nelore Mocho utilizando dados do registro genealógico de animais nascidos entre 1969 e 1998. O banco de dados foi separado em quatro períodos de 1979-1983, 1984-1988, 1989-1993 e 1994-1998. Calcularam-se as estatísticas descritivas do número de criadores, de reprodutores e de reprodutrizes. A endogamia total aumentou de 0,55 por cento para 0,98 por cento, a esperada sob acasalamento ao acaso aumentou de 0,11 por cento para 0,56 por cento e a endogamia devido à subdivisäo populacional permaneceu constante, ao redor de 0,45 por cento, indicando que a subdivisäo genética da raça Nelore Mocho é próxima a zero e praticamente inexistente. O tamanho efetivo populacional foi estimado pelo coeficiente total de endogamia e permaneceu ao redor de 120. A inclusäo de animais no livro genealógico aumentou de 4.630 para 13.907, entretanto, esta açäo näo foi suficiente para incrementar o tamanho efetivo. Baseado na probabilidade de origem do gene foram calculados o número efetivo de fundadores, de ancestrais e de genomas remanescentes. Esses parâmetros decresceram ao longo do período, atingindo valores de 144, 98 e 64. Todas as estimativas foram análogas na descriçäo da estrutura genética populacional e devem ser consideradas no futuro para o desenvolvimento de programas de seleçäo
Assuntos
Bovinos , Genética PopulacionalRESUMO
The population structure of the registered Tabapuã cattle in Brazil was described. Descriptive statistics of the distribution of the number of progeny, the generation interval, F-statistics, effective number of founders, ancestors, reminiscent genomes and effective population size were estimated using pedigree records from registered animals from 1971 to 1998. In the last period studied (1994-1998), 37,778 animals, 18,736 males and 19,042 females from 136 breeders were registered. The generations intervals calculated in each of the four periods 1979-1983, 1984-1988, 1989-1993 and 1994-1998 were, respectively, 6.26, 7.18, 7.68 and 7.56 yr for parent-progeny and 6.18, 6.43, 6.99 and 7.27 yr for parent to parent. The effective size of the population, founders, ancestors and reminiscent genomes in each of these periods were respectively: 378, 218, 213 and 181; 131, 254, 202 and 163; 73, 150, 119 and 94; 55, 112, 78 and 61.
Descreveu-se a estrutura da população do rebanho Tabapuã registrado no Brasil. Foram geradas estatísticas descritivas da distribuição do número de progênies e estimados o intervalo de gerações, estatísticas de F, número efetivo de fundadores, de ancestrais e de genomas remanescentes, além do tamanho efetivo da população, usando o registro genealógico de animais nascidos entre 1971-1998. Entre 1994 e 1998 foram registrados 37.778 animais, 18.736 machos e 19.042 fêmeas, pertencentes a 136 criadores. As médias dos intervalos de gerações estimadas para os períodos de 1979-1983, 1984-1988, 1989-1993 e 1994-1998 foram, respectivamente, 6,26; 7,18; 7,68 e 7,56 anos para pais-filhos e 6,18; 6,43; 6,99 e 7,27 para pais-pais. O tamanho efetivo da população e o número efetivo de fundadores, de ancestrais e de genomas remanescentes em cada um dos períodos foram, respectivamente, 378, 218, 213 e 181; 131, 254, 202 e 163; 73, 150, 119 e 94 e 55, 112, 78 e 61.
RESUMO
The population structure of the Polled Nelore breed using pedigree records from animals registered from 1969 to 1998 was described. The data file was divided in the following periods: 1979-1983, 1984-1988, 1989-1993 and 1994-1998. Descriptive statistics of the number of breeders, sires and dams were calculated. The total inbreeding increased from 0.55% to 0.98%, the inbreeding expected under random mating increased from 0.11% to 0.56%, and the inbreeding due to population subdivision was constantly around 0.45%, indicating that genetic subdivisions of the Polled Nelore breed is near to zero and quite irrelevant. The effective population size estimated from the total inbreeding was around 120. The upgrading of non-registered animals increased from 4,630 to 13,907 animals, however, this action was not enough to increase the effective population size. Based on probabilities of gene origin the effective numbers of founders, ancestors and remaining genomes were calculated. These parameters decreased over the period reaching values of 144, 98 and 64. All the estimates were analogous in the description of the population genetic structure and should be considered in developing future selection programs.
Descreveu-se a estrutura populacional da raça Nelore Mocho utilizando dados do registro genealógico de animais nascidos entre 1969 e 1998. O banco de dados foi separado em quatro períodos de 1979-1983, 1984-1988, 1989-1993 e 1994-1998. Calcularam-se as estatísticas descritivas do número de criadores, de reprodutores e de reprodutrizes. A endogamia total aumentou de 0,55% para 0,98%, a esperada sob acasalamento ao acaso aumentou de 0,11% para 0,56% e a endogamia devido à subdivisão populacional permaneceu constante, ao redor de 0,45%, indicando que a subdivisão genética da raça Nelore Mocho é próxima a zero e praticamente inexistente. O tamanho efetivo populacional foi estimado pelo coeficiente total de endogamia e permaneceu ao redor de 120. A inclusão de animais no livro genealógico aumentou de 4.630 para 13.907, entretanto, esta ação não foi suficiente para incrementar o tamanho efetivo. Baseado na probabilidade de origem do gene foram calculados o número efetivo de fundadores, de ancestrais e de genomas remanescentes. Esses parâmetros decresceram ao longo do período, atingindo valores de 144, 98 e 64. Todas as estimativas foram análogas na descrição da estrutura genética populacional e devem ser consideradas no futuro para o desenvolvimento de programas de seleção.