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BACKGROUND: Pompe Disease (PD) is a metabolic myopathy caused by variants in the GAA gene, resulting in deficient enzymatic activity. We aimed to characterize the clinical features and related genetic variants in a series of Mexican patients. METHODS: We performed a retrospective study of clinical records of patients diagnosed with LOPD, IOPD or pseudodeficiency. RESULTS: Twenty-nine patients were included in the study, comprising these three forms. Overall, age of symptom onset was 0.1 to 43 years old. The most frequent variant identified was c.-32-13T>G, which was detected in 14 alleles. Among the 23 different variants identified in the GAA gene, 14 were classified as pathogenic, 5 were likely pathogenic, and 1 was a variant of uncertain significance. Two variants were inherited in cis arrangement and 2 were pseudodeficiency-related benign alleles. We identified two novel variants (c.1615 G>A and c.1076-20_1076-4delAAGTCGGCGTTGGCCTG). CONCLUSION: To the best of our knowledge, this series represent the largest phenotypic and genotypic characterization of patients with PD in Mexico. Patients within our series exhibited a combination of LOPD and IOPD associated variants, which may be related to genetic diversity within Mexican population. Further population-wide studies are required to better characterize the incidence of this disease in Mexican population.

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BACKGROUND: Chromosomal abnormalities are present in 50 to 60% of miscarriages and in 6 to 19% of stillbirths. Although microarrays are preferred for studying chromosomal abnormalities, many hospitals cannot offer this methodology. OBJECTIVE: To present the results of the cytogenetic analysis of 303 products of conception (POC), which included 184 miscarriages, 49 stillbirths and 17 cases of undefined age. MATERIAL AND METHODS: Karyotyping, fluorescence in situ hybridization, short tandem repeats and microarrays were used, depending on the type of loss and available sample. RESULTS: In 29 POCs we found maternal tissue and were eliminated from the analyses. Informative results were obtained in 250 (91.2 %)/274 cases; the karyotyping success rate was 80.7%; that of single nucleotide polymorphism microarrays, 94.5%; and that of fluorescence in situ hybridization and short tandem repeat, 100%. Cytogenetic abnormalities were observed in 57.6% of miscarriages and in 24.5% of stillbirths; 94% of total anomalies were numerical and 6% were submicroscopic. CONCLUSIONS: Karyotyping with simultaneous short tandem repeat study to rule out contamination of maternal cells is effective for studying miscarriages; in stillbirths, microarrays are recommended.

ANTECEDENTES: Las alteraciones cromosómicas están presentes en 50 a 60 % de los abortos espontáneos y en 6 a 19 % de los mortinatos. Aunque se prefieren los microarreglos para estudiarlos, numerosos hospitales no pueden ofrecerlos. OBJETIVO: Presentar los resultados del estudio citogenético de 303 productos de la concepción (POC), 184 se obtuvieron de abortos espontáneos, 49 fueron mortinatos y en 17 no se identificó la de edad gestacional. MATERIAL Y MÉTODOS: Se empleó cariotipo, hibridación in situ con fluorescencia, secuencias cortas repetidas en tándem y microarreglos, según el tipo de pérdida y la muestra disponible. RESULTADOS: En 29 POC se encontró tejido materno, por lo que fueron eliminados de los análisis. En 250 (91.2 %)/274 casos se obtuvieron resultados informativos; la tasa de éxito del cariotipo fue de 80.7 %; la de los microarreglos de SNP, de 94.5 %; y la de la hibridación fluorescente in situ y la repetición corta en tándem, de 100 %. Se observaron anomalías citogenéticas en 57.6 % de los abortos espontáneos y en 24.5 % de los mortinatos; 94 % de las anomalías fueron numéricas y 6 %, submicroscópicas. CONCLUSIONES: El cariotipo en conjunto con el estudio de secuencias cortas repetidas en tándem para descartar contaminación de células maternas es efectivo para estudiar abortos espontáneos; los microarreglos se recomiendan en los mortinatos.

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Resumen Antecedentes: Las alteraciones cromosómicas están presentes en 50 a 60 % de los abortos espontáneos y en 6 a 19 % de los mortinatos. Aunque se prefieren los microarreglos para estudiarlos, numerosos hospitales no pueden ofrecerlos. Objetivo: Presentar los resultados del estudio citogenético de 303 productos de la concepción (POC), 184 se obtuvieron de abortos espontáneos, 49 fueron mortinatos y en 17 no se identificó la de edad gestacional. Material y métodos: Se empleó cariotipo, hibridación in situ con fluorescencia, secuencias cortas repetidas en tándem y microarreglos, según el tipo de pérdida y la muestra disponible. Resultados: En 29 POC se encontró tejido materno, por lo que fueron eliminados de los análisis. En 250 (91.2 %)/274 casos se obtuvieron resultados informativos; la tasa de éxito del cariotipo fue de 80.7 %; la de los microarreglos de SNP, de 94.5 %; y la de la hibridación fluorescente in situ y la repetición corta en tándem, de 100 %. Se observaron anomalías citogenéticas en 57.6 % de los abortos espontáneos y en 24.5 % de los mortinatos; 94 % de las anomalías fueron numéricas y 6 %, submicroscópicas. Conclusiones: El cariotipo en conjunto con el estudio de secuencias cortas repetidas en tándem para descartar contaminación de células maternas es efectivo para estudiar abortos espontáneos; los microarreglos se recomiendan en los mortinatos.

Abstract Background: Chromosomal abnormalities are present in 50 to 60 % of miscarriages and in 6 to 19 % of stillbirths. Although microarrays are preferred for studying chromosomal abnormalities, many hospitals cannot offer this methodology. Objective: To present the results of the cytogenetic analysis of 303 products of conception (POC), which included 184 miscarriages, 49 stillbirths and 17 cases of undefined age. Material and methods: Karyotyping, fluorescence in situ hybridization, short tandem repeats and microarrays were used, depending on the type of loss and available sample. Results: In 29 POCs we found maternal tissue and were eliminated from the analyses. Informative results were obtained in 250 (91.2 %)/274 cases; the karyotyping success rate was 80.7 %; that of single nucleotide polymorphism microarrays, 94.5 %; and that of fluorescence in situ hybridization and short tandem repeat, 100 %. Cytogenetic abnormalities were observed in 57.6 % of miscarriages and in 24.5 % of stillbirths; 94 % of total anomalies were numerical and 6 % were submicroscopic. Conclusions: Karyotyping with simultaneous short tandem repeat study to rule out contamination of maternal cells is effective for studying miscarriages; in stillbirths, microarrays are recommended.

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BACKGROUND: Myosin 1g (Myo1g) has recently been identified as a potential diagnostic biomarker in childhood acute lymphocytic leukemia (ALL). CASE REPORT: We describe the case of a 1-year-old Mexican female patient. Although initially studied for hepatomegaly, an infectious or genetic etiology was excluded. Liver biopsy showed infiltration by neoplastic B-cell precursors (BCPs), and bone marrow (BM) aspirate showed 14.5% of BCPs. In a joint session of the oncology, hematology, and pathology departments, low-risk (LR) BCP-ALL of hepatic origin with aberrant myeloid markers was diagnosed. Although treatment was initiated, the patient presented early with BM relapse. Modest overexpression of Myo1g was observed from the onset. However, at the end of the steroid window, expression increased significantly and remained elevated during this first relapse to BM. The parents refused hematopoietic stem cell transplantation, but she continued chemotherapy. After a second BM relapse at 5 years of age, the phenotype switched to myeloid. Her parents then opted for palliative care, and the patient died two months later at home. CONCLUSIONS: This case shows the potential use of Myo1g in clinical practice as a high-risk indicator. Myo1g monitoring may reveal a high risk and relapse trend, even when typical parameter values are not altered: Myo1g could be used to classify patients from low to high risk from diagnosis, allowing patients to promptly receive the best treatment and potentially modifying prognosis and survival.

INTRODUCCIÓN: Recientemente se ha identificado a miosina 1g (Myo1g) como un potencial biomarcador de diagnóstico en la leucemia linfoblástica aguda (LLA) infantil. CASO CLÍNICO: Se describe el caso de una paciente mexicana de 1 año de edad. Aunque inicialmente se estudió por hepatomegalia, se descartó una etiología infecciosa o genética. La biopsia hepática mostró infiltración por precursores de células B neoplásicas (PCB) y un aspirado de médula ósea (MO) mostró 14.5% de PCB. En una sesión conjunta de los departamentos de oncología, hematología y patología, se diagnosticó PCB-LLA de bajo riesgo de origen hepático con marcadores mieloides aberrantes. Aunque se inició tratamiento, la paciente presentó tempranamente recaída de MO. Se observó una modesta sobreexpresión de Myo1g. Sin embargo, al final de la ventana de esteroides, la expresión aumentó considerablemente y permaneció elevada durante esta primera recaída a MO. El trasplante de células madre hematopoyéticas fue rechazado por los padres, pero se continuó con la quimioterapia. Tras una segunda recaída de MO a los 5 años, el fenotipo cambió a mieloide. Sus padres optaron entonces por cuidados paliativos y la paciente falleció dos meses después en su domicilio. CONCLUSIONES: Este caso muestra el potencial uso de Myo1g como indicador de alto riesgo en la práctica clínica. El seguimiento de Myo1g puede revelar una tendencia de alto riesgo y recaídas, incluso cuando los valores de los parámetros rutinarios son aparentemente normales; Myo1g podría utilizarse para clasificar a los pacientes de bajo a alto riesgo desde el diagnóstico, lo que permitiría que los pacientes reciban el mejor tratamiento de manera oportuna, modificando potencialmente el pronóstico y la supervivencia.

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Abstract Background: Myosin 1g (Myo1g) has recently been identified as a potential diagnostic biomarker in childhood acute lymphocytic leukemia (ALL). Case report: We describe the case of a 1-year-old Mexican female patient. Although initially studied for hepatomegaly, an infectious or genetic etiology was excluded. Liver biopsy showed infiltration by neoplastic B-cell precursors (BCPs), and bone marrow (BM) aspirate showed 14.5% of BCPs. In a joint session of the oncology, hematology, and pathology departments, low-risk (LR) BCP-ALL of hepatic origin with aberrant myeloid markers was diagnosed. Although treatment was initiated, the patient presented early with BM relapse. Modest overexpression of Myo1g was observed from the onset. However, at the end of the steroid window, expression increased significantly and remained elevated during this first relapse to BM. The parents refused hematopoietic stem cell transplantation, but she continued chemotherapy. After a second BM relapse at 5 years of age, the phenotype switched to myeloid. Her parents then opted for palliative care, and the patient died two months later at home. Conclusions: This case shows the potential use of Myo1g in clinical practice as a high-risk indicator. Myo1g monitoring may reveal a high risk and relapse trend, even when typical parameter values are not altered: Myo1g could be used to classify patients from low to high risk from diagnosis, allowing patients to promptly receive the best treatment and potentially modifying prognosis and survival.

Resumen Introducción: Recientemente se ha identificado a miosina 1g (Myo1g) como un potencial biomarcador de diagnóstico en la leucemia linfoblástica aguda (LLA) infantil. Caso clínico: Se describe el caso de una paciente mexicana de 1 año de edad. Aunque inicialmente se estudió por hepatomegalia, se descartó una etiología infecciosa o genética. La biopsia hepática mostró infiltración por precursores de células B neoplásicas (PCB) y un aspirado de médula ósea (MO) mostró 14.5% de PCB. En una sesión conjunta de los departamentos de oncología, hematología y patología, se diagnosticó PCB-LLA de bajo riesgo de origen hepático con marcadores mieloides aberrantes. Aunque se inició tratamiento, la paciente presentó tempranamente recaída de MO. Se observó una modesta sobreexpresión de Myo1g. Sin embargo, al final de la ventana de esteroides, la expresión aumentó considerablemente y permaneció elevada durante esta primera recaída a MO. El trasplante de células madre hematopoyéticas fue rechazado por los padres, pero se continuó con la quimioterapia. Tras una segunda recaída de MO a los 5 años, el fenotipo cambió a mieloide. Sus padres optaron entonces por cuidados paliativos y la paciente falleció dos meses después en su domicilio. Conclusiones: Este caso muestra el potencial uso de Myo1g como indicador de alto riesgo en la práctica clínica. El seguimiento de Myo1g puede revelar una tendencia de alto riesgo y recaídas, incluso cuando los valores de los parámetros rutinarios son aparentemente normales; Myo1g podría utilizarse para clasificar a los pacientes de bajo a alto riesgo desde el diagnóstico, lo que permitiría que los pacientes reciban el mejor tratamiento de manera oportuna, modificando potencialmente el pronóstico y la supervivencia.

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INTRODUCTION: Pompe disease (PD) is a rare form of metabolic myopathy; the classic infantile presentation is severe, with death occurring before reaching one year of life, and the non-classical form is of slower progression and survival can exceed one year. OBJECTIVE: To describe the genotype and characteristics of Mexican patients with infantile-onset PD. METHODS: Seven patients with PD confirmed by enzymatic activity determination and GAA gene molecular analysis were included. Mutations were reviewed in genomic databases. RESULTS: Median age at symptom onset was four months (1-12 months) and age at diagnosis was eight months (4-16 months). All patients had cardiomyopathy: four who died before one year of age had mutations that predicted severe disease (c.2431dup, c.2560C>T, c.655G>A, c.1987delC) and were negative for cross-reactive immunologic material (CRIM). Three patients survived after one year of age with enzyme replacement therapy; one survived almost five years, another 18 months, and one girl was almost three years of age at the time of this report; their pathogenic variants predicted potentially less severe disease (c.1979G>A, c.655G>A, c.1447G>A) and they were positive for CRIM. CONCLUSION: There was a good correlation between genotype and phenotype in children with Pompe disease.

INTRODUCCIÓN: La enfermedad de Pompe (EP) es una forma rara de miopatía metabólica; la presentación infantil clásica es severa y el fallecimiento acontece antes del año de vida, y la forma no clásica es de progresión más lenta y la sobrevivencia puede superar el año. OBJETIVO: Describir genotipo y características de pacientes mexicanos con EP de inicio infantil. MÉTODOS: Se incluyeron siete pacientes con enfermedad confirmada mediante actividad enzimática y estudio molecular del gen GAA. Se revisaron las mutaciones en bases de datos genómicas. RESULTADOS: La mediana de la edad de inicio de los síntomas fue de cuatro meses (1-12 meses) y la edad de diagnóstico fue de ocho meses (4-16 meses). Todos los pacientes tenían cardiomiopatía: cuatro que fallecieron antes del año presentaron mutaciones que predicen enfermedad severa (c.2431dup, c.2560C>T, c.655G>A, c.1987delC) y CRIM (cross-reactive immunologic material) negativo; tres sobrevivieron después del año de edad con terapia de reemplazo enzimático, uno casi cinco años, otro 18 meses y una niña tenía casi tres años al momento de este informe; sus variantes patogénicas predecían enfermedad potencialmente menos severa (c.1979G>A, c.655G>A, c.1447G>A) y CRIM positivo. CONCLUSIÓN: Existió buena correlación entre genotipo y fenotipo en niños con enfermedad de Pompe.

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Resumen Introducción: La enfermedad de Pompe (EP) es una forma rara de miopatía metabólica; la presentación infantil clásica es severa y el fallecimiento acontece antes del año de vida, y la forma no clásica es de progresión más lenta y la sobrevivencia puede superar el año. Objetivo: Describir genotipo y características de pacientes mexicanos con EP de inicio infantil. Métodos: Se incluyeron siete pacientes con enfermedad confirmada mediante actividad enzimática y estudio molecular del gen GAA. Se revisaron las mutaciones en bases de datos genómicas. Resultados: La mediana de la edad de inicio de los síntomas fue de cuatro meses (1-12 meses) y la edad de diagnóstico fue de ocho meses (4-16 meses). Todos los pacientes tenían cardiomiopatía: cuatro que fallecieron antes del año presentaron mutaciones que predicen enfermedad severa (c.2431dup, c.2560C>T, c.655G>A, c.1987delC) y CRIM (cross-reactive immunologic material) negativo; tres sobrevivieron después del año de edad con terapia de reemplazo enzimático, uno casi cinco años, otro 18 meses y una niña tenía casi tres años al momento de este informe; sus variantes patogénicas predecían enfermedad potencialmente menos severa (c.1979G>A, c.655G>A, c.1447G>A) y CRIM positivo. Conclusión: Existió buena correlación entre genotipo y fenotipo en niños con enfermedad de Pompe.

Abstract Introduction: Pompe disease (PD) is a rare form of metabolic myopathy; the classic infantile presentation is severe, with death occurring before reaching one year of life, and the non-classical form is of slower progression and survival can exceed one year. Objective: To describe the genotype and characteristics of Mexican patients with infantile-onset PD. Methods: Seven patients with PD confirmed by enzymatic activity determination and GAA gene molecular analysis were included. Mutations were reviewed in genomic databases. Results: Median age at symptom onset was four months (1-12 months) and age at diagnosis was eight months (4-16 months). All patients had cardiomyopathy: four who died before one year of age had mutations that predicted severe disease (c.2431dup, c.2560C>T, c.655G>A, c.1987delC) and were negative for cross-reactive immunologic material (CRIM). Three patients survived after one year of age with enzyme replacement therapy; one survived almost five years, another 18 months, and one girl was almost three years of age at the time of this report; their pathogenic variants predicted potentially less severe disease (c.1979G>A, c.655G>A, c.1447G>A) and they were positive for CRIM. Conclusion: There was a good correlation between genotype and phenotype in children with Pompe disease.

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Cystic fibrosis is an autosomal recessive genetic disease, mainly in Caucasian children and young adults. It is caused by pathogenic variants in the CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator) gene, which results in increased viscosity and difficult mucus clearance. The main organ affected is the lung, the pancreas, sweat glands, intestine, liver, nasal mucosa, salivary glands, and reproductive tract. The clinical manifestations vary, ranging from the most frequent pulmonary symptoms of obstructive disease to gastrointestinal manifestations relatection of pathogenic variants in the CFTR gene allow the diagnosis to be integrated. Cystic fibrosis management consists of three main strategies: firstly, to keep the airway free of secretion; secondly, to keep the airway free of infection; and finally, to maintain an optimal nutritional status. Therapies that seek to correct alterations in the CFTR gene are focused on avoiding a pathogenic nonsense variant, correcting folding, increasing trafficking to the plasma membrane, or increasing the function of the CFTR channel. Other therapies still under development include gene therapy, genome editing, and antisense oligonucleotides to modify the expression of this gene.

La fibrosis quística es una enfermedad genética autosómica recesiva que se presenta principalmente en niños y adultos jóvenes caucásicos. Está causada por variantes patogénicas en el gen CFTR (regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística), lo que ocasiona un aumento de la viscosidad y un difícil aclaramiento del moco. El principal órgano afectado es el pulmón, seguido del páncreas, las glándulas sudoríparas, el intestino, el hígado, la mucosa nasal, las glándulas salivales y el aparato reproductor. Las manifestaciones clínicas son variables y van desde las más frecuentes, que son los síntomas pulmonares de enfermedad obstructiva, hasta manifestaciones gastrointestinales relacionadas con la malabsorción secundaria a la insuficiencia pancreática. Aunque existen múltiples pruebas diagnósticas para la fibrosis quística, el tamiz neonatal, el aumento en el tripsinógeno inmunorreactivo, la prueba de cloro en sudor y la detección de variantes patogénicas en el gen CFTR permiten integrar el diagnóstico. El manejo consta de tres niveles principales: el primero, mantener la vía aérea libre de secreción; el segundo, mantener la vía aérea libre de infección; y por último, mantener un estado nutricional óptimo. Las terapias que buscan corregir las alteraciones en el gen CFTR están enfocadas en evitar una variante patogénica sin sentido, corregir el plegamiento, aumentar el tráfico a la membrana plasmática o incrementar la función del canal CFTR. Otras terapias aún en desarrollo incluyen la terapia génica, la edición del genoma y los oligonucleótidos antisentido para modificar la expresión de este gen.

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Hawkinsinuria is an autosomal dominant disorder of tyrosine metabolism. Mutations in the 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase gene (HPD) result in an altered HPD enzyme, causing hawkinsin and tyrosine accumulation. Persistent metabolic acidosis and failure to thrive are common features in patients with hawkinsinuria. We present the first known Latin American patient diagnosed with hawkinsinuria, and the tenth reported patient in the literature. We aim to establish clinical practice guidelines for patients with hawkinsinuria. The patient's plasma tyrosine level was 21.5 mg/dL, which is several times higher than the reference value. Mutation analysis indicated heterozygosity for V212M and A33T variants in HPD. In the case of altered tyrosine levels found during newborn screening, we propose exclusive breastmilk feeding supplemented with ascorbic acid. Amino acid quantification is useful for monitoring treatment response. If tyrosinemia persists, protein intake must be decreased via a low-tyrosine diet. Molecular studies can be used to confirm a patient's disease etiology. Further reports are required to elucidate new pathogenic and phenotypic variations to enable the development of an appropriate therapeutic approach.

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Mitochondria both produce the energy of the cell as ATP via respiration and regulate cellular metabolism. Accordingly, any deletion or mutation in the mitochondrial DNA (mtDNA) may result in a disease. One of these diseases is Kearns Sayre syndrome (KSS), described for the first time in 1958, where different large-scale deletions of different sizes and at different positions have been reported in the mitochondrial genome of patients with similar clinical symptoms. In this study, sequences of the mitochondrial genome of three patients with clinic features of KSS were analyzed. Our results revealed the position, heteroplasmy percentage, size of deletions, and their haplogroups. Two patients contained deletions reported previously and one patient showed a new deletion not reported previously. These results display for the first time a systematic analysis of mtDNA variants in the whole mtDNA genome of patients with KSS to help to understand their association with the disease.

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