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1.
Biomedica ; 42(4): 623-632, 2022 12 01.
Artigo em Inglês, Espanhol | MEDLINE | ID: mdl-36511680

RESUMO

INTRODUCTION: Amyotrophic lateral sclerosis is a neurodegenerative disease with a possible multifactorial origin characterized by the progressive degeneration of motor neurons. There is a relatively high prevalence of this disease in Antioquia; however, there is no published genetic study to date in Colombia. Despite its unknown etiopathogenesis, more genetic risk factors possibly involved in the development of this disease are constantly found. OBJETIVES: To evaluate G93A and D90A mutations in SOD1 gene and a short tandem repeat in C9orf72 within a cohort of amyotrophic lateral sclerosis patients from Antioquia, Colombia. Materials y methods: Thirty-four patients previously diagnosed with amyotrophic lateral sclerosis were included in the study. Peripheral blood samples were used for DNA extraction and genotyping. RESULTS: No mutations were found in SOD1 (G93A and D90A) in any of the patients, while C9orf72 exhibited an allele with a statistically significant high prevalence in the study sample (8 hexanucleotide repeats of CAGCAG). CONCLUSIONS: These results suggest an association between this short tandem repeat (STR) in C9orf72 and the presence of amyotrophic lateral sclerosis in the studied population. However, this association should be established in a larger sample size and with controls from the same population. In addition, there also seems to be a genetic anticipation effect for the disease regarding this locus, since patients with this genotype present an earlier onset.


Introducción. La esclerosis lateral amiotrófica es una enfermedad neurodegenerativa con un posible origen multifactorial, caracterizado por una degeneración progresiva de las neuronas motoras. Hay una gran prevalencia relativa de esta enfermedad en Antioquia; sin embargo, no hay publicaciones de estudios genéticos en Colombia. A pesar de su etiopatogénesis desconocida, hay varios factores de riesgo genético que se encuentran constantemente en el desarrollo de esta enfermedad. Objetivo. Evaluar las mutaciones G93A y D90A del gen SOD1 y una repetición corta en tándem (Short Tandem Repeat, STR) en el locus C9orf72, en una cohorte de pacientes con esclerosis lateral amiotrófica en Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. Se incluyeron 34 pacientes previamente diagnosticados en el estudio. Una muestra de sangre periférica se usó para extraer el ADN y, posteriormente, genotipificarlo. Resultados. No se encontraron mutaciones en el gen SOD1 (G93A y D90A), mientras que el C9orf72 exhibe un alelo con una significativa prevalencia en los pacientes del estudio (8 repeticiones del hexanucleótido G4C2). Conclusiones. Se sugiere una asociación entre la repetición en tándem en C9orf72 y la presencia de la esclerosis lateral amiotrófica en la población estudiada. Sin embargo, se sugiere hacer estudios adicionales e incluir un grupo control de la misma población. Además, se detecta un fenómeno de anticipación genética de la enfermedad, dado que los pacientes con el alelo de 8 repeticiones en C9orf72 presentan una edad temprana de aparición de los síntomas.


Assuntos
Esclerose Lateral Amiotrófica , Doenças Neurodegenerativas , Humanos , Esclerose Lateral Amiotrófica/epidemiologia , Esclerose Lateral Amiotrófica/genética , Esclerose Lateral Amiotrófica/patologia , Proteína C9orf72/genética , Superóxido Dismutase-1/genética , Colômbia/epidemiologia
2.
Zebrafish ; 17(4): 278-286, 2020 08.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32716725

RESUMO

Pimelodidae has a high number of species, but cytogenetic studies are generally restricted to classical chromosomal characterization and in situ localization of ribosomal DNA (rDNA) genes. This study was developed to compare Pimelodus microstoma and Pimelodus pohli focusing on chromosomal diversification provided by the transposition of DNA sequences containing multigene families. Both species share 56 chromosomes, with centromeric and terminal heterochromatic blocks. The silver nucleolus organizer regions (Ag-NORs)/45S rDNA was located in the chromosome pair 24 for both species. The 5S rDNA sites were evidenced in the pair 8 of P. microstoma, and in the pairs 1, 17, and 18 in P. pohli. The U1 small nuclear RNA (snRNA) was located at terminal site in the first subtelocentric pair in both species. The U2 snRNA site was syntenic to 5S rDNA in non-homeologue chromosomes between analyzed species. The histones H3 and H4 were clustered in chromosome pairs 19 and 23 in P. microstoma, and 21 and 22 in P. pohli. Our study proposes that the movement of DNA sequences carrying multigene families has been driven on the chromosomal diversification of Pimelodidae. These multigene location in the genomes can explain most of the visualized chromosomal rearrangements in Pimelodidae and it is useful to understand the chromosomal changes and their distinctive karyotype formulae.


Assuntos
Peixes-Gato/genética , Mapeamento Cromossômico , Análise Citogenética , Família Multigênica , Animais , DNA Ribossômico/genética , Feminino , Masculino , Região Organizadora do Nucléolo/genética , RNA Nuclear Pequeno/genética
3.
J Homosex ; 67(3): 417-434, 2020.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30372382

RESUMO

Our article tackles gender and sexual diversity scholarship in Colombia and Perú, two countries without institutionalized LGBT studies programs. By analyzing the impact of literary works in Perú and an annual conference in Colombia's capital, we show how LGBT-related scholarship (and activism) has been advanced in these Andean countries with tactful maneuvering, as they offset contemporary violence-and a strong religious influence. Our comparison allows us to showcase two of the most common ways through which these countries have engaged in LGBT research and activism. This region-centered, dual-country approach underscores the broader need of researching and documenting these efforts.


Assuntos
Minorias Sexuais e de Gênero , Colômbia , Escolaridade , Feminino , Humanos , Masculino , Peru , Pesquisa
4.
Int J Legal Med ; 133(5): 1385-1388, 2019 Sep.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30612323

RESUMO

X-chromosomal markers can be useful in some forensic cases, where the analysis of the autosomal markers is not conclusive. In this study, a population sample of 500 unrelated individuals born in São Paulo State was characterized for 32 X-InDel markers. No deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were detected, except for MID1361. The 32 X-InDels showed an accumulated power of discrimination of 0.9999999999993 in females and 0.99999993 in males and an exclusion chance of 0.999996 in trios and 0.99995 in duos. São Paulo showed lower genetic distances to the Colombian admixed and European populations than to Native American, Asian, or African populations. Ancestry analysis revealed 41.8% European, 31.6% African, and 26.6% Native American contributions. Segregation analysis was performed in 101 trios, and the mutation rate was estimated to be low.


Assuntos
Cromossomos Humanos X/genética , Genética Populacional/métodos , Mutação INDEL , Indígena Americano ou Nativo do Alasca/genética , População Negra/genética , Brasil/etnologia , Família , Feminino , Marcadores Genéticos , Haplótipos , Humanos , Masculino , Reação em Cadeia da Polimerase Multiplex , Taxa de Mutação , Paternidade , População Branca/genética
5.
Neotrop. ichthyol ; 17(2): e190010, 2019. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1012708

RESUMO

The transposable elements (TE) have been widely applied as physical chromosome markers. However, in Loricariidae there are few physical mapping analyses of these elements. Considering the importance of transposable elements for chromosomal evolution and genome organization, this study conducted the physical chromosome mapping of retroelements (RTEs) Rex1, Rex3 and Rex6 in seven species of the genus Harttia and four species of the genus Hypostomus, aiming to better understand the organization and dynamics of genomes of Loricariidae species. The results showed an intense accumulation of RTEs Rex1, Rex3 and Rex6 and dispersed distribution in heterochromatic and euchromatic regions in the genomes of the species studied here. The presence of retroelements in some chromosomal regions suggests their participation in various chromosomal rearrangements. In addition, the intense accumulation of three retroelements in all species of Harttia and Hypostomus, especially in euchromatic regions, can indicate the participation of these elements in the diversification and evolution of these species through the molecular domestication by genomes of hosts, with these sequences being a co-option for new functions.(AU)


Os elementos transponíveis (TE) têm sido amplamente aplicados como marcadores cromossômicos. Contudo, em Loricariidae, há poucas análises de mapeamento físico destes elementos. Considerando a importância de elementos transponíveis para a evolução cromossômica e organização genômica, este trabalho realizou o mapeamento físico cromossômico dos retroelementos (RTEs) Rex1, Rex3 e Rex6 em sete espécies do gênero Harttia e em quatro espécies do gênero Hypostomus, com o intuito de melhor compreender a organização e dinâmica dos genomas das espécies de Loricariidae. Os resultados evidenciaram um intenso acúmulo dos RTEs Rex1, Rex3 e Rex6 e distribuição dispersa em regiões heterocromáticas e eucromáticas no genoma das espécies estudadas. A presença de retroelementos em algumas regiões cromossômicas sugere sua participação em vários rearranjos cromossômicos. Além disso, o intenso acúmulo dos três retroelementos em todas as espécies de Harttia e Hypostomus, especialmente em regiões eucromáticas, pode indicar a participação destes elementos na diversificação e evolução destas espécies através da domesticação molecular pelo genoma dos hospedeiros, com estas sequências sendo co-optadas paras novas funções.(AU)


Assuntos
Animais , Peixes-Gato/genética , Genes pX/genética , Hibridização In Situ/veterinária
6.
Neotrop. ichthyol ; 17(2): e190010, 2019. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-22212

RESUMO

The transposable elements (TE) have been widely applied as physical chromosome markers. However, in Loricariidae there are few physical mapping analyses of these elements. Considering the importance of transposable elements for chromosomal evolution and genome organization, this study conducted the physical chromosome mapping of retroelements (RTEs) Rex1, Rex3 and Rex6 in seven species of the genus Harttia and four species of the genus Hypostomus, aiming to better understand the organization and dynamics of genomes of Loricariidae species. The results showed an intense accumulation of RTEs Rex1, Rex3 and Rex6 and dispersed distribution in heterochromatic and euchromatic regions in the genomes of the species studied here. The presence of retroelements in some chromosomal regions suggests their participation in various chromosomal rearrangements. In addition, the intense accumulation of three retroelements in all species of Harttia and Hypostomus, especially in euchromatic regions, can indicate the participation of these elements in the diversification and evolution of these species through the molecular domestication by genomes of hosts, with these sequences being a co-option for new functions.(AU)


Os elementos transponíveis (TE) têm sido amplamente aplicados como marcadores cromossômicos. Contudo, em Loricariidae, há poucas análises de mapeamento físico destes elementos. Considerando a importância de elementos transponíveis para a evolução cromossômica e organização genômica, este trabalho realizou o mapeamento físico cromossômico dos retroelementos (RTEs) Rex1, Rex3 e Rex6 em sete espécies do gênero Harttia e em quatro espécies do gênero Hypostomus, com o intuito de melhor compreender a organização e dinâmica dos genomas das espécies de Loricariidae. Os resultados evidenciaram um intenso acúmulo dos RTEs Rex1, Rex3 e Rex6 e distribuição dispersa em regiões heterocromáticas e eucromáticas no genoma das espécies estudadas. A presença de retroelementos em algumas regiões cromossômicas sugere sua participação em vários rearranjos cromossômicos. Além disso, o intenso acúmulo dos três retroelementos em todas as espécies de Harttia e Hypostomus, especialmente em regiões eucromáticas, pode indicar a participação destes elementos na diversificação e evolução destas espécies através da domesticação molecular pelo genoma dos hospedeiros, com estas sequências sendo co-optadas paras novas funções.(AU)


Assuntos
Animais , Peixes-Gato/genética , Genes pX/genética , Hibridização In Situ/veterinária
7.
Ann Hum Biol ; 44(7): 659-662, 2017 Nov.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28831823

RESUMO

Short tandem repeats (STRs) are genetic markers largely employed in forensic analysis and paternity investigation cases. When an inconsistency between the parent and child is considered as a possible mutation, the mutation rate should be incorporated into paternity index calculations to give a robust result and to reduce the chance of misinterpretation. The aim of this study was to estimate the mutation rates of 20 autosomal STRs loci used for paternity tests. In these loci we analysed 29,831 parent-child allelic transfers from 929 duo or trio paternity tests carried out during 2012?2016 from São Paulo State, Brazil. We identified 35 mutations in 16 loci, and they were more frequent in the paternal germline compared to the maternal germline. The loci with the highest rate were vWA and FGA and the ones with the lowest rate were PENTA E, PENTA D, D21S11, D7S820 and D6S1043. We did not identified any mutation in D2S1338, TH01, TPOX and D16S539 loci. All mutations consisted of losses or gains of one repeat unit. Mutation rates found in the São Paulo population have peculiarities, which justifies the use of regional databases in laboratories.


Assuntos
Idade Materna , Repetições de Microssatélites/genética , Taxa de Mutação , Idade Paterna , Paternidade , Brasil , Humanos
8.
Arq Bras Cardiol ; 108(4): 315-322, 2017 Apr.
Artigo em Inglês, Português | MEDLINE | ID: mdl-28538761

RESUMO

BACKGROUND:: The practice of exercise in short bouts repeated throughout the day may be an alternative strategy to lift people out of physical inactivity. OBJECTIVE:: to evaluate if accumulated exercise, as occurs in continuous exercise training, improve endothelial function in rat aorta. METHODS:: Wistar male rats were divided into three groups: continuous exercise (CEx, 1 hour on the treadmill) or accumulated exercise (AEx, 4 bouts of 15 minutes / day) for 5 days/week for 8 weeks, or sedentary (SED). During the training period, body weight gain and increase in exercise performance were recorded. On sacrifice day, aorta was dissected into rings (3-5 mm) and mounted on the organ bath. RESULTS:: Fitness was significantly greater in CEx and AEx rats as compared with SED animals. In addition, compared with the SED group, CEx animals had a lower body mass gain, and the aorta obtained from these animals had reduced contractile response to norepinephrine and greater acetylcholine-induced relaxation. These results were not observed in ACEx animals. CONCLUSIONS:: Both CEx and AEx improved fitness, but only CEx led to reduced body weight gain and improved endothelial function. FUNDAMENTO:: A prática de exercícios em sessões curtas que se repetem ao longo do dia pode ser uma alternativa para tirar as pessoas da inatividade física. OBJETIVO:: Verificar se o exercício acumulado, tal como ocorre com o treinamento com exercício contínuo, melhora a função endotelial na aorta de ratos. MÉTODOS:: Ratos Wistar machos foram divididos em 3 grupos: treinamento com exercício contínuo (ExC; 1 hora em esteira) ou com exercício acumulado (ExA; 4 sessões de 15 minutos ao longo do dia) por 5 dias/semana, durante 8 semanas, ou grupo sedentário (SED). Durante o treinamento, foram registrados o ganho de peso corporal e desempenho na esteira. No dia do sacrifício, anéis (3-5 mm) da aorta foram obtidos e montados em banho de órgãos. RESULTADOS:: Animais ExC e ExA mostraram aptidão física significativamente maior em comparação com os SED. Paralelamente, em comparação com SED, animais ExC tiveram menor ganho de massa corporal, e aortas retiradas desses animais mostraram respostas contrácteis à noradrenalina reduzidas e maior relaxamento induzido pela acetilcolina. Esses resultados não foram observados no grupo ExA. CONCLUSÕES:: Tanto o ExC quanto o ExA melhoraram a aptidão física, mas somente o ExC foi capaz de reduzir o ganho de peso corporal dos animais e melhorar a função endotelial.


Assuntos
Aorta/fisiologia , Endotélio Vascular/fisiologia , Condicionamento Físico Animal/métodos , Aptidão Física/fisiologia , Acetilcolina/farmacologia , Animais , Aorta/efeitos dos fármacos , Endotélio Vascular/efeitos dos fármacos , Masculino , Modelos Animais , Norepinefrina/farmacologia , Condicionamento Físico Animal/fisiologia , Distribuição Aleatória , Ratos Wistar , Substâncias Reativas com Ácido Tiobarbitúrico/análise , Vasoconstritores/farmacologia , Redução de Peso/fisiologia
9.
Int J Legal Med ; 131(6): 1523-1530, 2017 Nov.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28405752

RESUMO

Studies with X-STR loci show population genetic substructure, which makes necessary the characterization of such markers in the different geographical and/or ethnic populations. Therefore, this study assessed the distribution and forensic efficiency of an X-STR decaplex system in the population of the State of Mato Grosso, as well as analysed the population structure of this State based on the aforementioned system. All X-STR markers were in Hardy-Weinberg equilibrium and linkage equilibrium, and the DXS6809 was the most informative marker. The power of discrimination value in females and males was 0.99999999995 and 0.9999994, respectively. Analysis of molecular variance indicated 1.10% (p < 0.00001) of heterogeneity among Europeans, Africans, Brazilians and other Latin Americans, and in relation to such groups, the population of the State of Mato Grosso showed lower genetic variation when compared with the Brazilian group (-0.10%, p = 0.67327). The genetic distance analysis showed lower values of F ST (0.0004 ≤ F ST ≤ 0.00331), with non-significant p value (p > 0.00024), between the populations of Mato Grosso and Mato Grosso do Sul, Paraná and the Southeast region of Brazil (except for one sample of Rio de Janeiro). F ST values with significant p values (p ≤ 0.00024) were obtained between the population of Mato Grosso and Iberian, African and some Latin American populations. The X-STR decaplex system proved to be extremely useful in the population of the State of Mato Grosso, and the data obtained does not show the need for a specific forensic database for this State in relation to the Brazilian populations compared in this study, except for population of Rio de Janeiro.


Assuntos
Cromossomos Humanos X , Impressões Digitais de DNA/instrumentação , Genética Populacional , Sequências de Repetição em Tandem , Brasil , Feminino , Frequência do Gene , Variação Genética , Genótipo , Humanos , Masculino , Reação em Cadeia da Polimerase , Grupos Raciais/genética
10.
Arq. bras. cardiol ; 108(4): 315-322, Apr. 2017. graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-838719

RESUMO

Abstract Background: The practice of exercise in short bouts repeated throughout the day may be an alternative strategy to lift people out of physical inactivity. Objective: to evaluate if accumulated exercise, as occurs in continuous exercise training, improve endothelial function in rat aorta. Methods: Wistar male rats were divided into three groups: continuous exercise (CEx, 1 hour on the treadmill) or accumulated exercise (AEx, 4 bouts of 15 minutes / day) for 5 days/week for 8 weeks, or sedentary (SED). During the training period, body weight gain and increase in exercise performance were recorded. On sacrifice day, aorta was dissected into rings (3-5 mm) and mounted on the organ bath. Results: Fitness was significantly greater in CEx and AEx rats as compared with SED animals. In addition, compared with the SED group, CEx animals had a lower body mass gain, and the aorta obtained from these animals had reduced contractile response to norepinephrine and greater acetylcholine-induced relaxation. These results were not observed in ACEx animals. Conclusions: Both CEx and AEx improved fitness, but only CEx led to reduced body weight gain and improved endothelial function.


Resumo Fundamento: A prática de exercícios em sessões curtas que se repetem ao longo do dia pode ser uma alternativa para tirar as pessoas da inatividade física. Objetivo: Verificar se o exercício acumulado, tal como ocorre com o treinamento com exercício contínuo, melhora a função endotelial na aorta de ratos. Métodos: Ratos Wistar machos foram divididos em 3 grupos: treinamento com exercício contínuo (ExC; 1 hora em esteira) ou com exercício acumulado (ExA; 4 sessões de 15 minutos ao longo do dia) por 5 dias/semana, durante 8 semanas, ou grupo sedentário (SED). Durante o treinamento, foram registrados o ganho de peso corporal e desempenho na esteira. No dia do sacrifício, anéis (3-5 mm) da aorta foram obtidos e montados em banho de órgãos. Resultados: Animais ExC e ExA mostraram aptidão física significativamente maior em comparação com os SED. Paralelamente, em comparação com SED, animais ExC tiveram menor ganho de massa corporal, e aortas retiradas desses animais mostraram respostas contrácteis à noradrenalina reduzidas e maior relaxamento induzido pela acetilcolina. Esses resultados não foram observados no grupo ExA. Conclusões: Tanto o ExC quanto o ExA melhoraram a aptidão física, mas somente o ExC foi capaz de reduzir o ganho de peso corporal dos animais e melhorar a função endotelial.


Assuntos
Animais , Masculino , Aorta/fisiologia , Condicionamento Físico Animal/métodos , Endotélio Vascular/fisiologia , Aptidão Física/fisiologia , Aorta/efeitos dos fármacos , Condicionamento Físico Animal/fisiologia , Vasoconstritores/farmacologia , Endotélio Vascular/efeitos dos fármacos , Redução de Peso/fisiologia , Acetilcolina/farmacologia , Distribuição Aleatória , Norepinefrina/farmacologia , Substâncias Reativas com Ácido Tiobarbitúrico/análise , Ratos Wistar , Modelos Animais
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