RESUMO
O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Rotavirus , Vacinas contra Rotavirus/genética , Técnicas de Genotipagem/veterinária , Testes de Fixação do Látex/veterináriaRESUMO
O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Técnicas de Genotipagem/veterinária , Rotavirus , Vacinas contra Rotavirus/genética , Testes de Fixação do Látex/veterináriaRESUMO
Polymorphisms present in the TNF promoter region has shown to influence the gene transcription. Leprosy displays different clinical manifestations according to the immune responses of the individual infected with Mycobacterium leprae. In this study, we evaluated the single nucleotide polymorphisms (SNPs) -238 G/A (rs361525), -308 G/A (rs1800629), -857 C/T (rs1799724), -863 A/C (rs1800630) and -1031 T/C (rs1799964) in the promoter region of the TNF to see whether these SNPs influence host-susceptibility to leprosy and the different clinical manifestation. Nucleotide sequencing was performed with DNA samples from 108 leprosy patients and 253 control subjects. An association between -1031 C/C genotype and protection from leprosy was observed when leprosy patients were compared to controls (OR 0.11; 95% CI=0.01-0.82; p=0.012). The -857 C/T genotype may be associated with susceptibility to leprosy (OR=1.81; 95% CI=1.09-3.00; p=0.028). Similar genotype and allele frequencies for the SNPs -308 G/A and -238 G/A were observed between leprosy patients and control subjects. Altogether, TNF polymorphisms in the promoter region may be predictive of leprosy outcome.
Assuntos
Hanseníase/imunologia , Mycobacterium leprae/imunologia , Fator de Necrose Tumoral alfa/genética , Biomarcadores/metabolismo , Brasil , Análise Mutacional de DNA , Progressão da Doença , Frequência do Gene , Estudos de Associação Genética , Predisposição Genética para Doença , Genótipo , Humanos , Hanseníase/diagnóstico , Hanseníase/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Valor Preditivo dos Testes , Regiões Promotoras Genéticas/genéticaRESUMO
Leprosy displays a wide clinical spectrum that is dependent of the type of immune response. We investigate here whether polymorphisms in the promoter region of the IL12RB2 gene are associated with susceptibility or resistance to clinical forms of leprosy. Nucleotide sequencing of the promoter region of IL12RB2 encompassing SNPs -1035 A/G, -1033 T/C, -1023 A/G, -650 del/G and -464 A/G was performed on DNA samples from 105 leprosy patients and 108 healthy controls. However, none of the SNPs were associated with susceptibility to the disease or any of its clinical forms. Similarly, haplotype analysis did not show any association. The haplotype -1035A/-1033T/-650G/-464A was prevalent, and homozygosity for this haplotype was associated to a lower distribution of CD4(+) T cells (p=0.041). Our data suggest that polymorphisms present in the promoter region of IL12RB2 may not be associated with susceptibility to leprosy or its clinical forms.
Assuntos
Linfócitos T CD4-Positivos/imunologia , Hanseníase/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Regiões Promotoras Genéticas , Receptores de Interleucina-12/genética , Adolescente , Adulto , Idoso , Brasil , Contagem de Linfócito CD4 , Linfócitos T CD4-Positivos/patologia , Estudos de Casos e Controles , Suscetibilidade a Doenças , Feminino , Frequência do Gene , Haplótipos , Homozigoto , Humanos , Hanseníase/imunologia , Hanseníase/patologia , Masculino , Pessoa de Meia-IdadeRESUMO
Polymorphisms present in the first intron of IFN-γ may have an important role in the regulation of the immune response, which could have functional consequences for gene transcription. Leprosy patients are characterized by different immune responses in different clinical forms. We investigated a possible association of the +874 polymorphism and CA repeats present in the first intron of IFN-γ with susceptibility to leprosy and with the manifestation of the different clinical forms. Nucleotide sequencing was performed with samples from 108 leprosy patients and 113 controls subjects, as well as immunophenotyping of CD(4)(+), CD(8)(+) and CD(69)(+) T cells by flow cytometry. The data showed that there were no significant differences between patients and control subjects, as well as according classification of Ridley-Jopling. However, the A/A genotype was significantly increased in paucibacillary patients (p=0.028) and the microsatellite encoding 16 CA repeats were significantly associated with paucibacillary compared to multibacillary patients (p=0.019). Individuals homozygous for the +874 A allele, the mean level of CD(4)(+) and CD(69)(+) T cells was higher. Our data suggest that polymorphisms present in the first intron of IFN-γ are not associated with susceptibility to leprosy, nevertheless, the +874 polymorphism and the CA repeats number encoded in IFN-γ gene may be related to a higher cellular immune response in patients and are consistently more frequently detected in PB patients.
Assuntos
Predisposição Genética para Doença , Interferon gama/genética , Hanseníase/genética , Hanseníase/prevenção & controle , Repetições de Microssatélites/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Adolescente , Adulto , Idoso , Alelos , Biomarcadores/metabolismo , Brasil , Estudos de Casos e Controles , Feminino , Frequência do Gene/genética , Humanos , Subpopulações de Linfócitos/imunologia , Masculino , Pessoa de Meia-Idade , Adulto JovemRESUMO
In order to develop good polices regarding public health measures and vaccine use to prevent rotavirus induced gastroenteritis, the epidemiology of the illness in various regions of Brazil is necessary. Accordingly, this study was to detect the frequency and types of rotavirus in one city in a tropical part of Brazil. This is an epidemiological survey of pediatric gastroenteritis caused by rotavirus conducted in Juiz de Fora, Minas Gerais State, Brazil. We analyzed 656 in-patient (190) and out-patient (466) stool samples from children ages 0 to 5 years during 1998. Rotavirus detection was performed using polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). Rotavirus was isolated from 62/190 stool samples (32.6%) from hospitalized children and 16/466 (3.4%) from out-patients. The overall rotavirus frequency in this population was 11.9%. The highest rotavirus detection was found in hospitalized children ages 6 to 24 months. Rotaviruses were detected from March to September, with a peak incidence in June (33.3%), the coldest and driest month in the region. Electrophoretic analysis identified 10 different profiles, all long and compatible with group A rotavirus, termed L(A) through LJ. The L(B) and L(D) profiles circulated throughout most of the study period. However, in June, when the highest detection rate occurred, the vast majority (92.5%) of the positive samples displayed the L(B) profile, thus suggesting an outbreak caused by this rotavirus profile. Rotavirus induced gastroenteritis is common in one tropical region of Brazil, it is an important cause of diarrhea in hospitalized children ages 6 to 24 months, it is most common during dry, cold months of the year, and it may occur in electrophoretype restricted epidemics. Such analyses throughout Brazil will assist in developing sound guidelines regarding its prevention.