Assuntos
Leishmania mexicana , Infecções por Pseudomonas , Pseudomonas aeruginosa , Superinfecção , Humanos , Pseudomonas aeruginosa/isolamento & purificação , Pseudomonas aeruginosa/genética , Superinfecção/microbiologia , Infecções por Pseudomonas/microbiologia , Infecções por Pseudomonas/diagnóstico , Leishmania mexicana/genética , Leishmania mexicana/isolamento & purificação , Leishmaniose Cutânea/diagnóstico , Leishmaniose Cutânea/parasitologia , Leishmaniose Cutânea/microbiologia , Masculino , Doenças Transmissíveis Importadas/microbiologia , Doenças Transmissíveis Importadas/parasitologia , Doenças Transmissíveis Importadas/diagnóstico , Antibacterianos/uso terapêutico , Antibacterianos/farmacologiaRESUMO
This is the first report of the genome sequence of "Candidatus Rickettsia colombianensi" strain Adcor 2, deposited in DDBJ/ENA/GenBank under the accession number RAQN00000000 The draft genome showed 36.01% similarity with that of Rickettsia monacensis strain IrR/Munich (NCBI accession number LN794217), 37.81% similarity with that of Rickettsia heilongjiangensis 054 (NCBI accession number CP002912), and 43.88% similarity with that of Rickettsia tamurae AT-1 (NCBI accession number CCMG01000001).
RESUMO
Etiology of acute undifferentiated febrile syndrome (AUFS) is often unknown, leading to inaccurate diagnosis and treatment. Villeta town has been identified as an endemic area for spotted fever group (SFG) rickettsioses but little is known about possible amplifier hosts and other Rickettsia species different from Rickettsia rickettsii. Besides, few studies have approached other AUFS etiologies in the region. We investigated the role of dengue, leptospirosis, rickettsioses, human anaplasmosis, and Q fever as possible causes of AUFS in patients from Villeta. Sera specimens and ticks from animals as well as ticks from vegetation were studied for the presence of different Rickettsia spp. Among 104 sera from patients with AUFS, 16.4%, 24.0%, and 2.9% patients seroconverted to dengue, Leptospira, and SFG Rickettsia, respectively, with a case of probable coinfection or cross-reaction with Anaplasma phagocytophilum. None of the samples were reactive for Coxiella burnetii. Sera samples from 74 horses, 118 dogs, and 62 bovines were collected and showed 33.8%, 14.4%, and 50.0% of seroprevalence for SFG Rickettsia, respectively. A total of 1,287 ixodid ticks were collected from animals/vegetation and processed in pools for polymerase chain reaction. Among them, 1.7% was positive for Rickettsia genes, and Rickettsia amblyommii, R. rickettsii, and Rickettsia spp. were found. These results confirm the circulation of dengue, different SFG Rickettsia species and the relevance of other etiologies like leptospirosis and human anaplasmosis. Further studies must identify different epidemiological variables to establish proper surveillance and control programs.
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Infecções por Rickettsia/microbiologia , Rickettsia/classificação , Carrapatos/microbiologia , Doença Aguda , Adolescente , Adulto , Animais , Criança , Colômbia/epidemiologia , Feminino , Humanos , Masculino , Mamíferos , Pessoa de Meia-Idade , Infecções por Rickettsia/epidemiologia , Estudos Soroepidemiológicos , Infestações por Carrapato/epidemiologia , Infestações por Carrapato/veterinária , Adulto JovemRESUMO
The aim of this work was to detect and identify Rickettsia species in ticks collected in rural areas of Villeta, Colombia. Tick specimens were collected from domestic animals and walls of houses in five rural villages of Villeta town and from humans in Naranjal village (same town). Moreover, a flea collected from the same area was also processed. DNA was extracted and tested by conventional, semi-nested, and nested PCR reactions targeting rickettsial genes. In the ticks collected from humans from Naranjal village, a nymph of Amblyomma cajennense sensu lato was amplified using primers for ompA and sequenced (100% identity with "Candidatus Rickettsia amblyommii"). Last, three amplicons from the Ctenocephalides felis flea, corresponding to gltA, ompB, and 16S rRNA genes, showed high identity with R. felis (98.5%, 97.3%, and 99.2%, respectively) and "Candidatus Rickettsia asemboensis" (99.7% and 100%, respectively). To our knowledge, these results correspond to the first molecular detection in Colombia of "Candidatus Rickettsia amblyommii" and "Ca. Rickettsia asemboensis" in fleas.
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Infecções por Rickettsia/epidemiologia , Rickettsia/isolamento & purificação , Carrapatos/microbiologia , Animais , Animais Domésticos , Colômbia/epidemiologia , Ctenocephalides/microbiologia , DNA Bacteriano/genética , Infestações por Pulgas/microbiologia , Infestações por Pulgas/veterinária , Humanos , Rickettsia/classificação , Rickettsia/genética , Infecções por Rickettsia/microbiologia , Infestações por Carrapato/microbiologia , Infestações por Carrapato/veterináriaRESUMO
Background: Q fever is a zoonotic disease caused by Coxiella burnetii. In Colombia it is not a notifiable disease in humans and is most likely under diagnosed. There are no studies about its prevalence in important reservoir species, such as cattle. Objective: the aim of this study was to investigate the frequency of C. burnetii infection in cattle farms and determine the frequency of antibodies in farm workers at risk in rural areas of Montería, Córdoba (Colombia). Methods: eleven cattle farms were randomly chosen to investigate the infection by C. burnetii. Bulk tank milk samples of each farm were analyzed by conventional PCR for DNA detection of transposase gene IS1111 of C. burnetii. Serum samples from 61 apparently healthy people living in eight farms were analyzed by indirect inmunofluorescence against phase II IgG antibodies to C. burnetii. Results: we report the presence of C. burnetii DNA in 45% of bulk tank milk samples from cattle farms and a 61% frequency of antibodies (IgG phase II ≥1/64) in farm workers at risk. Conclusion: our results demonstrate the circulation of this bacterium in the studied farms in Montería, Colombia, showing that at-risk farm workers have a high antibody frequency.
Antecedentes: la fiebre Q es una zoonosis causada por Coxiella burnetii. En Colombia no es una enfermedad notificable en humanos y probablemente es subdiagnosticada. De otro lado, no se han realizado estudios acerca de su prevalencia en importantes reservorios como los bovinos. Objetivos: el objetivo de este estudio fue determinar la frecuencia de infección por C. burnetii en fincas de ganado bovino y determinar la frecuencia de la presencia de anticuerpos en trabajadores de fincas en riesgo en áreas rurales del municipio de Montería, Córdoba (Colombia). Métodos: once fincas de ganado bovino fueron aleatoriamente seleccionadas para investigar la frecuencia de infección por C. burnetii. Muestras de leche de tanque de cada finca fueron analizadas mediante PCR convencional para detección del gen transposasa IS1111 de C. burnetii. Asimismo, se colectaron muestras de suero sanguíneo de 61 personas aparentemente saludables que vivían en ocho de las fincas estudiadas, las cuales fueron analizadas mediante el ensayo de inmunofluorescencia indirecta para detección de anticuerpos IgG contra fase II de C. burnetii. Resultados: en este estudio se reporta la presencia de ADN de C. burnetii en 45% de las muestras de leche de tanque de las fincas ganaderas estudiadas y una frecuencia de anticuerpos contra C. burnetii (IgG Fase II ≥1/64) del 61% en trabajadores de fincas en riesgo. Conclusiones: los resultados de este estudio demuestran la circulación de C. burnetii en las fincas estudiadas de un área de Montería, Colombia. También, los trabajadores de fincas en situación de riesgo presentan una alta frecuencia de anticuerpos contra este patógeno.
Antecedentes: a febre Q é uma zoonose causada por Coxiella burnetii. Na Colômbia não é uma doença de notificação obrigatória em seres humanos e é provavelmente subdiagnosticada. Além disto, não há estudos sobre sua prevalência nas principais espécies de reservatórios, como os bovinos. Objetivos: determinar a frequência de infecção por C. burnetii em fazendas de gado de leite e determinar a frequência de anticorpos em trabalhadores rurais em risco do município de Montería, Córdoba (Colômbia). Métodos: 11 fazendas de gado leiteiro foram selecionadas aleatoriamente para investigar a frequência de infecção por C. burnetii. Amostras de leite do tanque de cada fazenda foram analisadas por PCR convencional para a detecção do gene IS1111 transposase de C. burnetii. Além disso, amostras de soro de 61 pessoas aparentemente saudáveis que vivem em oito das propriedades estudadas foram analisadas por imunofluorescência indireta para a detecção de anticorpos IgG contra C. burnetii fase II. Resultados: neste estudo, o DNA de C. burnetii foi encontrado em 45% das amostras de leite do tanque, e uma frequência de anticorpos contra C. burnetii (fase II IgG ≥ 1/64) de 61% em trabalhadores rurais em risco. Conclusões: os resultados deste estudo demonstram a circulação de C. burnetii em algumas fazendas de gado em uma área de Montería, Colômbia. Além disso, os trabalhadores rurais em situação de risco têm uma alta frequência de anticorpos contra este patógeno.
RESUMO
BACKGROUND: Ixodid ticks play an important role in the transmission and ecology of infectious diseases. Information about the circulation of tick-borne bacteria in ticks is lacking in Ecuador. Our aims were to investigate the tick species that parasitize Andean tapirs and cattle, and those present in the vegetation from the buffer zone of the Antisana Ecological Reserve and Cayambe-Coca National Park (Ecuador), and to investigate the presence of tick-borne bacteria. METHODS: Tick species were identified based on morphologic and genetic criteria. Detection of tick-borne bacteria belonging to Rickettsia, Anaplasma, Ehrlichia and Borrelia genera was performed by PCRs. RESULTS: Our ticks included 91 Amblyomma multipunctum, 4 Amblyomma spp., 60 Rhipicephalus microplus, 5 Ixodes spp. and 1 Ixodes boliviensis. A potential Candidatus Rickettsia species closest to Rickettsia monacensis and Rickettsia tamurae (designated Rickettsia sp. 12G1) was detected in 3 R. microplus (3/57, 5.3%). In addition, Anaplasma spp., assigned at least to Anaplasma phagocytophilum (or closely related genotypes) and Anaplasma marginale, were found in 2 A. multipunctum (2/87, 2.3%) and 13 R. microplus (13/57, 22.8%). CONCLUSIONS: This is the first description of Rickettsia sp. in ticks from Ecuador, and the analyses of sequences suggest the presence of a potential novel Rickettsia species. Ecuadorian ticks from Andear tapirs, cattle and vegetation belonging to Amblyomma and Rhipicephalus genera were infected with Anaplasmataceae. Ehrlichia spp. and Borrelia burgdorferi sensu lato were not found in any ticks.
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Anaplasma/isolamento & purificação , Vetores Aracnídeos/microbiologia , Borrelia/isolamento & purificação , Ehrlichia/isolamento & purificação , Ixodes/microbiologia , Rickettsia/isolamento & purificação , Anaplasma/genética , Animais , Infecções Bacterianas/epidemiologia , Infecções Bacterianas/transmissão , Infecções Bacterianas/veterinária , Sequência de Bases , Borrelia/genética , Bovinos , Doenças dos Bovinos/epidemiologia , Doenças dos Bovinos/microbiologia , Doenças dos Bovinos/parasitologia , Doenças dos Bovinos/transmissão , DNA Bacteriano/química , DNA Bacteriano/genética , Equador/epidemiologia , Ehrlichia/genética , Feminino , Masculino , Dados de Sequência Molecular , Perissodáctilos , Rickettsia/genética , Análise de Sequência de DNA/veterinária , Infestações por Carrapato/parasitologia , Infestações por Carrapato/veterináriaRESUMO
Tick-borne rickettsial diseases are potentially life threatening infections that in Latin America have an emerging and reemerging character. Until few years ago, Rickettsia rickettsia was the only tick-borne rickettsia present in America; but nowadays several other species such as R. parkeri and R. massiliae are causing disease in humans in the region. In addition, new species are being described; although their pathogenicity has not been confirmed they should be considered as potential pathogens. Since the microbiological diagnosis of rickettsioses can take days or weeks, a high clinical suspicion and early start of appropriate treatment are crucial. In this review the distribution and main clinical manifestations of tick-borne rickettsial diseases in Latin America are detailed. Since R. felis has been found in ticks and the role of this vector has not been clarified, we have included a section about this pathogen.
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Infecções por Rickettsia/classificação , Rickettsia/classificação , Doenças Transmitidas por Carrapatos/classificação , Carrapatos/microbiologia , Animais , Humanos , América Latina , Rickettsia/isolamento & purificação , Infecções por Rickettsia/microbiologia , Doenças Transmitidas por Carrapatos/microbiologiaRESUMO
BACKGROUND: Flea-borne infections are distributed worldwide. Up to date there are no reports about microorganisms associated to fleas in Ecuador. METHODS: Seventy-one Pulex irritans and 8 Ctenocephalides felis fleas were removed from dogs in two Ecuadorian areas (Pastaza and Chimborazo Provinces) in December 2012. DNA extracts were tested by polymerase chain reaction (PCR) assays targeting universal 16S rRNA, as well as screened for the presence of Rickettsia spp. (gltA, htrA, ompB, sca4 and ompA genes) and Bartonella spp. (rpoB, gltA and ITS genes). RESULTS: Our results showed the presence of 'Candidatus Rickettsia asemboensis' (highly similar to R. felis) in C. felis and Wolbachia spp. endosimbionts in P. irritans collected from animals in Ecuador. No fleas were found to be positive for any Bartonella species or Yersinia pestis. CONCLUSIONS: Clinicians should be aware of the potential risk of this new Candidatus Rickettsia sp. and keep in mind other flea-borne infections since these flea species frequently bite humans.
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Doenças do Cão/microbiologia , Infestações por Pulgas/veterinária , Rickettsia/isolamento & purificação , Infecções por Rickettsiaceae/microbiologia , Sifonápteros/microbiologia , Wolbachia/isolamento & purificação , Animais , Sequência de Bases , Ctenocephalides/microbiologia , DNA Bacteriano/química , Doenças do Cão/parasitologia , Doenças do Cão/transmissão , Cães , Equador , Feminino , Infestações por Pulgas/parasitologia , Humanos , Masculino , Dados de Sequência Molecular , Reação em Cadeia da Polimerase , RNA Ribossômico 16S/genética , Rickettsia/genética , Infecções por Rickettsia/microbiologia , Infecções por Rickettsia/transmissão , Infecções por Rickettsiaceae/transmissão , Análise de Sequência de DNA , Wolbachia/genéticaRESUMO
Tick-borne rickettsial diseases are potentially life threatening infections that in Latin America have an emerging and reemerging character. Until few years ago, Rickettsia rickettsia was the only tick-borne rickettsia present in America; but nowadays several other species such as R. parkeri and R. massiliae are causing disease in humans in the region. In addition, new species are being described; although their pathogenicity has not been confirmed they should be considered as potential pathogens. Since the microbiological diagnosis of rickettsioses can take days or weeks, a high clinical suspicion and early start of appropriate treatment are crucial. In this review the distribution and main clinical manifestations of tick-borne rickettsial diseases in Latin America are detailed. Since R. felis has been found in ticks and the role of this vector has not been clarified, we have included a section about this pathogen.
Las rickettsiosis transmitidas por garrapatas son infecciones potencialmente letales, que en Latinoamérica tienen carácter emergente y re-emergente. Hasta hace escasos años, la única rickettsiosis transmitida por garrapatas era causada por Rickettsia rickettsii, pero en la actualidad existen otras especies como R. parkeri y R. massiliae que están provocando enfermedad en humanos en la región. Por otro lado, se están describiendo candidatos a nuevas especies de Rickettsia, que aunque no han probado su patogenicidad deben considerarse como potencialmente patógenos. Dado que el diagnóstico microbiológico puede tardar días o semanas, resulta fundamental una alta sospecha clínica y la instauración precoz de un tratamiento adecuado. En esta revisión se detalla la distribución y principales manifestaciones clínicas de las rickettsiosis transmitidas por garrapatas en Latinoamérica. Se ha incluido una sección sobre la infección por R. felis, por haberse encontrado esta especie en garrapatas, y no haberse aclarado el papel de este vector en su ciclo epidemiológico.
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Animais , Humanos , Infecções por Rickettsia/classificação , Rickettsia/classificação , Doenças Transmitidas por Carrapatos/classificação , Carrapatos/microbiologia , América Latina , Infecções por Rickettsia/microbiologia , Rickettsia/isolamento & purificação , Doenças Transmitidas por Carrapatos/microbiologiaRESUMO
Rickettsioses share common clinical manifestations, such as fever, malaise, exanthema, the presence or absence of an inoculation eschar, and lymphadenopathy. Some of these manifestations can be suggestive of certain species of Rickettsia infection. Nevertheless none of these manifestations are pathognomonic, and direct diagnostic methods to confirm the involved species are always required. A syndrome is a set of signs and symptoms that characterizes a disease with many etiologies or causes. This situation is applicable to rickettsioses, where different species can cause similar clinical presentations. We propose a syndromic classification for these diseases: exanthematic rickettsiosis syndrome with a low probability of inoculation eschar and rickettsiosis syndrome with a probability of inoculation eschar and their variants. In doing so, we take into account the clinical manifestations, the geographic origin, and the possible vector involved, in order to provide a guide for physicians of the most probable etiological agent.