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Colossoma macropomum, or tambaqui, is the largest native Characiform species found in the Amazon and Orinoco river basins, yet few resources for genetic studies and the genetic improvement of tambaqui exist. In this study, we identified a large number of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) for tambaqui and constructed a high-resolution genetic linkage map from a full-sib family of 124 individuals and their parents using the genotyping by sequencing method. In all, 68,584 SNPs were initially identified using minimum minor allele frequency (MAF) of 5%. Filtering parameters were used to select high-quality markers for linkage analysis. We selected 7,734 SNPs for linkage mapping, resulting in 27 linkage groups with a minimum logarithm of odds (LOD) of 8 and maximum recombination fraction of 0.35. The final genetic map contains 7,192 successfully mapped markers that span a total of 2,811 cM, with an average marker interval of 0.39 cM. Comparative genomic analysis between tambaqui and zebrafish revealed variable levels of genomic conservation across the 27 linkage groups which allowed for functional SNP annotations. The large-scale SNP discovery obtained here, allowed us to build a high-density linkage map in tambaqui, which will be useful to enhance genetic studies that can be applied in breeding programs.

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Tambaqui is the major native Characiform fish species in Brazil. The loin-eye area (LEA) is a feature currently used in breeding programs for livestock and may be a phenotype susceptible to selection also in tambaquis. The purpose of this study was to evaluate the efficiency of two different LEA measurements. LEA data were taken using the vegetable paper (VP) and ultrasonography (US) techniques measured in three LEA regions (LEA1) at the end of the operculum region, (LEA2) at the insertion of the dorsal fin, and (LEA3) in the region of insertion of the anal fin from 29 individuals in a fish processing plant located in the State of Rondônia, Brazil. The data were analyzed in the R program using both the Students t-test and the Pearson correlation. The mean values for the two methods were not statistically different at the 5% risk level, indicating that the US can efficiently estimate the LEA compared with the actual value given by VP. The correlation was moderate (0.61) for LEA2 and can be attributed to the loin cut into two halves lengthwise in tambaquis usually done during commercial fish processing. Ultrasound has proven to be an efficient method for accurately estimating the LEA in tambaqui for further genetic breeding programs.

Tambaqui é a maior espécie de peixe da ordem Characiformes no Brasil. A área de olho de lombo (AOL) é uma característica usada atualmente em programas de melhoramento genético em animais de criação terrestre. O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência de dois tipos diferentes de medidas de AOL. As medidas de AOL foram tomadas com o uso de papel vegetal (PV) e ultrassonografia (US) em três regiões do animal: (AOL1) região final da região do opérculo, (AOL2) na inserção da nadadeira dorsal e (AOL3) na região da inserção da nadadeira caudal em 29 indivíduos advindos de uma planta processadora localizada no estado de Rondônia, Brasil. Os dados foram analisados no programa R com o uso do test t de Student e a correlação de Pearson. Os valores médios para ambas metodologias não foram estatisticamente diferentes ao nível de 5%, indicando que US pode eficientemente estimar a AOL quando comparado com o valor real gerado por PV. A correlação foi moderada (0,61) para AOL2 e isto pode ser atribuído ao corte em duas metades do lombo geralmente realizado em tambaquis nas plantas de processamento. A técnica de ultrassom provou ser um método eficiente para estimar acuradamente a AOL em tambaqui em futuros programas de melhoramento genético.

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Tambaqui is the major native Characiform fish species in Brazil. The loin-eye area (LEA) is a feature currently used in breeding programs for livestock and may be a phenotype susceptible to selection also in tambaquis. The purpose of this study was to evaluate the efficiency of two different LEA measurements. LEA data were taken using the vegetable paper (VP) and ultrasonography (US) techniques measured in three LEA regions (LEA1) at the end of the operculum region, (LEA2) at the insertion of the dorsal fin, and (LEA3) in the region of insertion of the anal fin from 29 individuals in a fish processing plant located in the State of Rondônia, Brazil. The data were analyzed in the R program using both the Students t-test and the Pearson correlation. The mean values for the two methods were not statistically different at the 5% risk level, indicating that the US can efficiently estimate the LEA compared with the actual value given by VP. The correlation was moderate (0.61) for LEA2 and can be attributed to the loin cut into two halves lengthwise in tambaquis usually done during commercial fish processing. Ultrasound has proven to be an efficient method for accurately estimating the LEA in tambaqui for further genetic breeding programs.(AU)

Tambaqui é a maior espécie de peixe da ordem Characiformes no Brasil. A área de olho de lombo (AOL) é uma característica usada atualmente em programas de melhoramento genético em animais de criação terrestre. O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência de dois tipos diferentes de medidas de AOL. As medidas de AOL foram tomadas com o uso de papel vegetal (PV) e ultrassonografia (US) em três regiões do animal: (AOL1) região final da região do opérculo, (AOL2) na inserção da nadadeira dorsal e (AOL3) na região da inserção da nadadeira caudal em 29 indivíduos advindos de uma planta processadora localizada no estado de Rondônia, Brasil. Os dados foram analisados no programa R com o uso do test t de Student e a correlação de Pearson. Os valores médios para ambas metodologias não foram estatisticamente diferentes ao nível de 5%, indicando que US pode eficientemente estimar a AOL quando comparado com o valor real gerado por PV. A correlação foi moderada (0,61) para AOL2 e isto pode ser atribuído ao corte em duas metades do lombo geralmente realizado em tambaquis nas plantas de processamento. A técnica de ultrassom provou ser um método eficiente para estimar acuradamente a AOL em tambaqui em futuros programas de melhoramento genético.(AU)

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Tambaqui is the major native Characiform fish species in Brazil. The loin-eye area (LEA) is a feature currently used in breeding programs for livestock and may be a phenotype susceptible to selection also in tambaquis. The purpose of this study was to evaluate the efficiency of two different LEA measurements. LEA data were taken using the vegetable paper (VP) and ultrasonography (US) techniques applied in three LEA regions: (LEA1) at the end of the operculum region, (LEA2) at the insertion of the dorsal fin, and (LEA3) in the region of insertion of the anal fin from 29 individuals in a fish processing plant located in the State of Rondônia, Brazil. The data were analyzed in the R program using both the Students t-test and the Pearson correlation. The mean values for the two methods were not statistically different at the 5% risk level, indicating that the US can efficiently estimate the LEA compared with the actual value given by VP. The correlation was moderate (0.61) for LEA2 and can be attributed to the loin cut into two halves lengthwise in tambaquis, usually done during commercial fish processing. Ultrasound has proven to be an efficient method for accurately estimating the LEA in tambaqui for further genetic breeding programs.

Tambaqui é a maior espécie de peixe da ordem Characiformes no Brasil. A área de olho de lombo (AOL) é uma característica usada atualmente em programas de melhoramento genético em animais de criação terrestre. O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência de dois tipos diferentes de medidas de AOL. As medidas de AOL foram tomadas com o uso de papel vegetal (PV) e ultrassonografia (US) em três regiões do animal: (AOL1), região final da região do opérculo, (AOL2), na inserção da nadadeira dorsal, e (AOL3), na região da inserção da nadadeira caudal, em 29 indivíduos advindos de uma planta processadora localizada no estado de Rondônia, Brasil. Os dados foram analisados no programa R com o uso do test-t de Student e a correlação de Pearson. Os valores médios para ambas as metodologias não foram estatisticamente diferentes em nível de 5%, indicando que US pode eficientemente estimar a AOL quando comparada com o valor real gerado por PV. A correlação foi moderada (0,61) para AOL2 e isto pode ser atribuído ao corte em duas metades do lombo geralmente realizado em tambaquis nas plantas de processamento. A técnica de ultrassom provou ser um método eficiente para estimar acuradamente a AOL em tambaquis em futuros programas de melhoramento genético.

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The frequency of species of the genus Eimeria in a dairy herd in the municipality of Boa Esperança, Southern region of the State of Minas Gerais was assessed. From 37 females of the Friesian breed aged three to seven months, 259 feces samples were analyzed between May and September 2008. The examinations to quantify oocysts per gram of feces (OPG) and identify Eimeria species were conducted at the Veterinary Parasitology Laboratory of the Federal University of Lavras. Eleven species of Eimeria were identified, namely: E. bovis (23.2%), E. zuernii (22.6%), E. ellipsoidalis (20.3%), E. cylindrica (14.1%), E. subspherica (5.4%), E. canadensis (3.5%), E. alabamensis (2.4%), E. auburnensis (2.4%), E. pellita (2.1%), E. brasiliensis (2%) and E. bukidnonensis (1.9%). E. bovis, E. zuernii and E. ellipsoidalis were the most frequent and the ones with the highest oocyst shedding over time (p < 0.05). Differences in OPG counts were found between most months studied (p < 0.05). The large number of Eimeria species found, in particular E. bovis and E. zuernii, indicates that Eimeria sp. has significant pathogenic potential in dairy cattle in the South of Minas Gerais.

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The frequency of species of the genus Eimeria in a dairy herd in the municipality of Boa Esperança, Southern region of the State of Minas Gerais was assessed. From 37 females of the Friesian breed aged three to seven months, 259 feces samples were analyzed between May and September 2008. The examinations to quantify oocysts per gram of feces (OPG) and identify Eimeria species were conducted at the Veterinary Parasitology Laboratory of the Federal University of Lavras. Eleven species of Eimeria were identified, namely: E. bovis (23.2 percent), E. zuernii (22.6 percent), E. ellipsoidalis (20.3 percent), E. cylindrica (14.1 percent), E. subspherica (5.4 percent), E. canadensis (3.5 percent), E. alabamensis (2.4 percent), E. auburnensis (2.4 percent), E. pellita (2.1 percent), E. brasiliensis (2 percent) and E. bukidnonensis (1.9 percent). E. bovis, E. zuernii and E. ellipsoidalis were the most frequent and the ones with the highest oocyst shedding over time (p < 0.05). Differences in OPG counts were found between most months studied (p < 0.05). The large number of Eimeria species found, in particular E. bovis and E. zuernii, indicates that Eimeria sp. has significant pathogenic potential in dairy cattle in the South of Minas Gerais.

Avaliou-se a frequência das espécies do gênero Eimeria em um rebanho leiteiro, criado no município de Boa Esperança, região Sul do Estado de Minas Gerais. Foram analisadas 259 amostras de fezes de 37 fêmeas bovinas, da raça holandesa, com faixa etária compreendida entre três e sete meses, no período de maio a setembro de 2008. O exame para quantificar oocisto por grama de fezes (OPG) e identificação das espécies de Eimeria foi realizado no Laboratório de Parasitologia Veterinária da UFLA. Foram identificadas onze espécies de Eimeria, sendo elas: E. bovis (23,2 por cento), E. zuernii (22,6 por cento), E. ellipsoidalis (20,3 por cento), E. cylindrica (14,1 por cento), E. subspherica (5,4 por cento), E. canadensis (3,5 por cento), E. alabamensis (2,4 por cento), E. auburnensis (2,4 por cento), E. pellita (2,1 por cento), E. brasiliensis (2 por cento) e E. bukidnonensis, sendo E. bovis, E. zuernii e E. ellipsoidalis as mais frequentes e aquelas com maior número de oocistos eliminados ao longo do tempo (p < 0,05). Diferenças na contagem de OPG foram encontradas na maioria dos meses avaliados (p < 0,05). A grande quantidade de espécies de Eimeria encontradas, em especial E. bovis e E. zuernii, indicam um importante potencial patogênico da Eimeria sp. em gado leiteiro no Sul de Minas Gerais.

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The frequency of species of the genus Eimeria in a dairy herd in the municipality of Boa Esperança, Southern region of the State of Minas Gerais was assessed. From 37 females of the Friesian breed aged three to seven months, 259 feces samples were analyzed between May and September 2008. The examinations to quantify oocysts per gram of feces (OPG) and identify Eimeria species were conducted at the Veterinary Parasitology Laboratory of the Federal University of Lavras. Eleven species of Eimeria were identified, namely: E. bovis (23.2 percent), E. zuernii (22.6 percent), E. ellipsoidalis (20.3 percent), E. cylindrica (14.1 percent), E. subspherica (5.4 percent), E. canadensis (3.5 percent), E. alabamensis (2.4 percent), E. auburnensis (2.4 percent), E. pellita (2.1 percent), E. brasiliensis (2 percent) and E. bukidnonensis (1.9 percent). E. bovis, E. zuernii and E. ellipsoidalis were the most frequent and the ones with the highest oocyst shedding over time (p < 0.05). Differences in OPG counts were found between most months studied (p < 0.05). The large number of Eimeria species found, in particular E. bovis and E. zuernii, indicates that Eimeria sp. has significant pathogenic potential in dairy cattle in the South of Minas Gerais.(AU)

Avaliou-se a frequência das espécies do gênero Eimeria em um rebanho leiteiro, criado no município de Boa Esperança, região Sul do Estado de Minas Gerais. Foram analisadas 259 amostras de fezes de 37 fêmeas bovinas, da raça holandesa, com faixa etária compreendida entre três e sete meses, no período de maio a setembro de 2008. O exame para quantificar oocisto por grama de fezes (OPG) e identificação das espécies de Eimeria foi realizado no Laboratório de Parasitologia Veterinária da UFLA. Foram identificadas onze espécies de Eimeria, sendo elas: E. bovis (23,2 por cento), E. zuernii (22,6 por cento), E. ellipsoidalis (20,3 por cento), E. cylindrica (14,1 por cento), E. subspherica (5,4 por cento), E. canadensis (3,5 por cento), E. alabamensis (2,4 por cento), E. auburnensis (2,4 por cento), E. pellita (2,1 por cento), E. brasiliensis (2 por cento) e E. bukidnonensis, sendo E. bovis, E. zuernii e E. ellipsoidalis as mais frequentes e aquelas com maior número de oocistos eliminados ao longo do tempo (p < 0,05). Diferenças na contagem de OPG foram encontradas na maioria dos meses avaliados (p < 0,05). A grande quantidade de espécies de Eimeria encontradas, em especial E. bovis e E. zuernii, indicam um importante potencial patogênico da Eimeria sp. em gado leiteiro no Sul de Minas Gerais.(AU)

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This study aimed to evaluate the frequency of the species of Giardia duodenalis species and the genus Cryptosporidium spp. in dairy calves at different ages during the post-weaning phase in a herd located in Boa Esperança, South of Minas Gerais State, Brazil, during the fallwinter season. It were analyzed 254 samples from 37 cows of Holstein breed, aged between three and 10 months in the period from May to September 2008, collected directly from the rectum every 30 days. To search cysts or trophozoites of Giardia duodenalis was used the flotation in zinc sulfate solution to 33% technique, and for detection of Cryptosporidium was used the Ziehl-Neelsen modified technique. Of the 254 samples, 37.79% were positive for cysts or trophozoites of Giardia and 8.93% for Cryptosporidium spp. The comparison of age and positivity to G. duodenalis and Cryptosporidium, it was observed that for both parasites, the age between three and four months is the most affected in the post-weaning phase in cattle. Whereas the post-weaning is a critical point in the growing cattle, this would indicate the pathogenic potential for these parasites in dairy cattle in southern Minas Gerais.

Esta pesquisa teve como objetivo avaliar a frequência da espécie Giardia duodenalis e do gênero Cryptosporidium spp. em bezerras leiteiras, de diferentes faixas etárias, durante a recria de um rebanho localizado em Boa Esperança, região Sul de Minas Gerais, Brasil, durante o outonoinverno. Foram analisadas 254 amostras de fezes de 37 fêmeas bovinas, da raça holandesa, com idades entre três e 10 meses, no período de maio a setembro de 2008, coletadas direto da ampola retal, a cada 30 dias. Para pesquisa de cistos ou trofozoítos de Giardia duodenalis foi utilizada a técnica de centrífugo-flutuação em solução de sulfato de zinco a 33%; para a detecção de Cryptosporidium utilizou-se a técnica de Ziehl-Neelsen modificada. Das 254 amostras analisadas, 37,79% apresentavam-se positivas para cistos e/ou trofozoítos de Giardia sp. e 8,93 % para Cryptosporidium spp. Na comparação entre faixa etária e positividade para G. duodenalis e Cryptosporidium, observou-se que para ambos os parasitos a faixa etária entre três e quatro meses é a mais acometida da fase de recria de bovinos. Considerando que o pós-desmame é um ponto crítico na recria, isso indica o potencial patogênico desses parasitos em gado leiteiro no Sul de Minas Gerais.

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The objective of this research was to evaluate the contamination of infecting larvae ofparasitic nematodes in cattle on Cynodon sp. pasture. The research was conducted in a milk-production system situated in the town of Boa Esperança, in the southern region of Minas Geraisstate, during the fall-winter seasons 2008. The samples of the grass were collected in ten pointsinserted into an outline in "W", previously designed, in the period of morning between at 7:30and 8:30, observing the presence of dew in all the collections performed. The samples were CUTclose to the soil and separated in half, which constituted an upper and lower sample of eachcollecting point, their being afterwards placed into plastic bag, identified and carried to a plasticfoam box . The samples were processed singly. The infecting larvae (L3) were identified and theamount per kilogram of dry matter in forage was estimated (L3/kg DM). The climatic conditions such as temperature, air relative humidity and rainfall enabled the development of the free lifestages throughout the period. Even at low rainfall rates during the months of May to August, thecounts of the amount of larvae in the pastures were high. Under the conditions of the dry period(Fall/Winter), the L3 forms of Cooperia sp. presented an expressive predominance in relation tothe other genera throughout the period. The greatest amount of infecting larvae of this specieswas found in the months of July and August in the upper pasture, while for the samples of thelower part were found peaks in the months of June and August. The large number of genera ofpathogenic helminths to animals in this study along the drier seasons of the year, especially in theupper pasture, demonstrates the importance of these agents as cause of losses in milk productionin Minas Gerais state.

Avaliou-se a contaminação por larvas infectantes de nematóides parasitos de bovinos em pastagem de Cynodon sp.. A pesquisa foi conduzida em um sistema de produção de leite localizado no município de Boa Esperança, sul do estado de Minas Gerais, durante os meses demaio a setembro de 2008. As amostras do capim foram coletadas em dez pontos, inseridos em um traçado em "W" previamente delineado, no período da manhã entre as 7:30 e 8:30, observando a presença de orvalho em todas as coletas realizadas. As amostras foram cortadas rente ao solo eseparadas ao meio, o que constituía uma amostra superior e inferior de cada ponto de coleta, sendo posteriormente acondicionadas em sacos plásticos, identificados e transportados à tempe-ratura ambiente. As larvas infectantes (L3) foram identificadas e estimou-se a quantidade por quilograma de matéria seca na forragem (L3/kg MS). As condições climáticas, tais como temperatura, umidade relativa do ar e precipitação pluvial, permitiram o desenvolvimento dos estádios de vida livre durante todo o período. Mesmo em baixas taxas de precipitação, durante os meses demaio a agosto, as contagens das quantidades de larvas na pastagem foram altas. Sob as condições do período seco (outono/inverno), as formas L3 de Cooperia sp. tiveram predominância expressiva em relação aos demais gêneros durante todo o período. Maior quantidade de larvas infectantesdessa espécie foi encontrada nos meses de julho e agosto nas amostras de pastagem superior,enquanto que para as amostras da parte inferior foram encontrados picos nos meses de junho eagosto. A grande quantidade de gêneros de helmintos patogênicos aos bovinos encontrados no presente estudo ao longo das estações mais secas do ano, especialmente na parte superior das pastagens, demonstra a importância desses agentes como causadores de perdas na produção leiteira em Minas Gerais.

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