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1.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 37(4): 681-688, oct.-dic. 2020. tab, graf
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1156818

RESUMO

RESUMEN Objetivo: Describir los resultados de los exámenes de laboratorio realizados en muestras biológicas de pacientes con síndrome de Guillain-Barré (SGB), recibidas en el Instituto Nacional de Salud (INS) entre los años 2018 y 2019. Materiales y métodos: Se realizó un estudio observacional en pacientes con SGB notificados en el sistema de vigilancia epidemiológica. Se obtuvieron muestras biológicas analizadas en el INS para investigar arbovirus, virus respiratorios, enterovirus y enterobacterias, entre otros. Resultados: Se recibió un total de 2051 especímenes clínicos de 906 pacientes con SGB. Tres pacientes dieron positivo al dengue y tres pacientes al Zika. En 19 pacientes, el cultivo en heces fue positivo para Campylobacter jejuni. El análisis filogenético de diez cepas de Campylobacter jejuni las clasificó como genotipo ST2993, reportado previamente en China y asociado a un brote de SGB. En 2018, hubo 12 muestras que habían dado positivo al PCR para enterovirus en el líquido cefalorraquídeo, pero ninguna pudo corroborarse con el cultivo respectivo ni con secuenciamiento de genoma completo. Un paciente dio positivo por virus de la influenza A, dos por virus de la influenza B, dos por adenovirus, cinco por virus respiratorio sincicial, y diez por rinovirus. Conclusión: Se han encontrado diversos agentes patógenos en especímenes de pacientes con SGB, sin embargo, la presencia de Campylobacter jejuni genotipo ST2993, un patógeno relacionado a brotes de SGB en varios continentes, sería el probable agente causal. Es necesario confirmar esta hipótesis con estudios analíticos y determinar la cadena de transmisión de este agente para implementar las medidas de prevención y control.


ABSTRACT Objective: To describe the results of laboratory tests performed on biological samples from patients with Guillain-Barré syndrome (GBS) submitted to the Instituto Nacional de Salud (INS) between 2018 and 2019. Materials and methods: We conducted an observational study on patients with GBS, by using data from the epidemiological surveillance system. Biological samples, previously analyzed at the INS, were obtained to study arboviruses, respiratory viruses, enteroviruses and enterobacteria, among others. Results: A total of 2,051 specimens were obtained from 906 patients with GBS. Three patients tested positive for dengue and three for Zika. In 19 patients, the stool culture was positive for Campylobacter jejuni. Phylogenetic analysis of 10 Campylobacter jejuni strains classified them as genotype ST2993, which was previously reported in China and associated to a GBS outbreak. Twelve cerebrospinal fluid samples tested positive for enterovirus by PCR in 2018, but none could be verified by culture or complete genome sequencing during the study. One patient was positive for influenza A, two for influenza B, two for adenovirus, five for respiratory syncytial virus, and ten for rinovirus. Conclusion: Several pathogens were found in samples from patients with GBS. However, we found that the genotype ST2993 of Campylobacter jejuni was the most likely causal agent, a pathogen that is related to GBS outbreaks in different continents. It is necessary to confirm this hypothesis with additional analytical studies and it is important to describe the transmission mechanism of C. jejuni genotype ST2993 in order to implement prevention and control measures.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Pacientes , Vírus , Surtos de Doenças , Síndrome de Guillain-Barré , Campylobacter jejuni , Enterovirus , Monitoramento Epidemiológico , Laboratórios
2.
Rev. panam. salud pública ; 41: e11, 2017. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1043209

RESUMO

ABSTRACT The 2014 enterovirus D68 (EV-D68) outbreak in the United States raised concerns about the introduction of the virus in the Caribbean region. The objective of this study was to provide rapid evidence of the introduction of EV-D68 strains in the Caribbean region during the 2014 outbreak in the United States, using a relatively simple phylogenetic approach. From October 2014 to May 2015, four EV-D68 cases from two countries (Bermuda and Dominica) were detected at the regional referral laboratory at the Caribbean Public Health Agency (Port of Spain, Trinidad and Tobago) based on molecular testing of respiratory specimens. All cases were children presenting to hospitals with moderate respiratory distress. No cases of acute flaccid paralysis were detected. Phylogenetic analysis of the Caribbean strains showed more than 99% similarity with the 2014 U.S.-outbreak strain, providing evidence of the introduction and circulation of the virus in the region.(AU)


RESUMEN El brote de enterovirus D68 (EV-D68) registrado en el 2014 en los Estados Unidos suscitó preocupación acerca de la introducción del virus en el Caribe. El objetivo de este estudio fue aportar pruebas rápidas, mediante la adopción de un enfoque filogénico relativamente sencillo, de que durante ese brote ingresaron en el Caribe cepas del EV-D68. Entre octubre del 2014 y mayo del 2015, el laboratorio regional de referencia ubicado en el Organismo de Salud Pública del Caribe (Puerto España, Trinidad y Tabago) detectó cuatro casos de EV-D68 provenientes de dos países (Bermudas y Dominica) mediante el análisis molecular de muestras respiratorias. Todos los casos correspondían a niños que acudieron al hospital con dificultad respiratoria moderada. No se detectó ningún caso de parálisis flácida aguda. El análisis filogénico de las cepas encontradas en el Caribe demostró una semejanza superior al 99 % con la cepa responsable del brote del 2014 en los Estados Unidos, lo que demuestra la introducción y la circulación del virus en la región.(AU)


Assuntos
Humanos , Recém-Nascido , Lactente , Pré-Escolar , Infecções por Enterovirus/prevenção & controle , Infecções por Enterovirus/epidemiologia , Bermudas/epidemiologia , Região do Caribe/epidemiologia , Dominica/epidemiologia , Enterovirus Humano D/isolamento & purificação
3.
Rev. Inst. Adolfo Lutz (Online) ; 75: 1/6-6/6, 2016. tab, graf
Artigo em Português | Sec. Est. Saúde SP, LILACS, SESSP-CTDPROD, Sec. Est. Saúde SP, SESSP-ACVSES, SESSP-IALPROD, Sec. Est. Saúde SP, SESSP-IALACERVO | ID: biblio-835636

RESUMO

O gênero Enterovirus (EV) é o agente etiológico mais frequente e responsável pela ocorrência de meningite viral no mundo. O objetivo deste trabalho foi de avaliar resultados da implantação do ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção de EV. Foram selecionadas 616amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes com meningite, recebidas para realizar período de 1998-2013. Os RNAs foram extraídos diretamente do LCR pelo método QIAamp®, e o ensaio TaqMan® foi aplicado. A avaliação foi feita comparando-se resultados de RT-qPCR com os obtidos pelo método de isolamento em cultura de células.Das 616 amostras analisadas, 94 (15,2 %) foram positivas para EV no ensaio de RT-qPCR; e na cultura celular EV foi isolado de 58 (9,4 %) amostras. Valores de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo foram de 89,70 %, 92,40 %, 55,30 % e 98,90 %,respectivamente. O RT-qPCR foi ligeiramente superior à cultura viral para a detecção de EV no LCR. O RT-qPCR TaqMan® é um ensaio rápido e sensível, facilmente exeqüível e com potencial para melhorar o diagnóstico da meningite viral na rotina do laboratório de saúde pública noEstado de São Paulo.


The genus Enterovirus (EV) is the most frequent etiological agent responsible for the occurrence of viral meningitis in the world. The objective of this work was to evaluate the results of the implantation of the real-time PCR assay (RT-qPCR) for the detection of EV. We selected 616 samples of cerebrospinal fluid (CSF) from patients with meningitis, received for the period 1998-2013. The RNAs were extracted directly from the CSF by the QIAamp® method, and the TaqMan® assay was applied. The results of the RT-qPCR test were compared with those obtained by the cell culture isolation method. Of the 616 samples analyzed, 94 (15.2%) were positive for EV in the RT-qPCR assay; And cell culture EV was isolated from 58 (9.4%) samples. Sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive values ​​were 89.70%, 92.40%, 55.30% and 98.90%, respectively. The RT-qPCR was slightly superior to the viral culture for the detection of EV in the CSF. RT-qPCR TaqMan® is a rapid and sensitive, easily feasible and potential test to improve the diagnosis of viral meningitis in the routine of the public health laboratory in the State of São Paulo.


Assuntos
Enterovirus , Meningite/diagnóstico , Reação em Cadeia da Polimerase
4.
Rev. Inst. Adolfo Lutz (Online) ; 75: 01-06, 2016. tab, graf
Artigo em Português | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1489535

RESUMO

O gênero Enterovirus (EV) é o agente etiológico mais frequente e responsável pela ocorrência de meningite viral no mundo. O objetivo deste trabalho foi de avaliar resultados da implantação do ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção de EV. Foram selecionadas 616 amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes com meningite, recebidas para realizar diagnóstico laboratorial no período de 1998-2013. Os RNAs foram extraídos diretamente do LCR pelo método QIAamp®, e o ensaio TaqMan® foi aplicado. A avaliação foi feita comparando-se resultados de RT-qPCR com os obtidos pelo método de isolamento em cultura de células. Das 616 amostras analisadas, 94 (15,2 %) foram positivas para EV no ensaio de RT-qPCR; e na cultura celular EV foi isolado de 58 (9,4 %) amostras. Valores de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo foram de 89,70 %, 92,40 %, 55,30 % e 98,90 %, respectivamente. O RT-qPCR foi ligeiramente superior à cultura viral para a detecção de EV no LCR. O RT-qPCR TaqMan® é um ensaio rápido e sensível, facilmente exeqüível e com potencial para melhorar o diagnóstico da meningite viral na rotina do laboratório de saúde pública no Estado de São Paulo.


Enterovirus (EV) genus is the most frequent etiological agent causing viral meningitis worldwide. This study aimed at evaluating the performance of real-time reverse transcription-PCR (RT-qPCR) assay for detecting EV. A total of 616 cerebrospinal fluid (CSF) samples from patients with meningitis were selected, among those received at EV diagnosis laboratory from 1998 to 2013. RNAs were directly extracted from CSF by using QIAamp® Viral RNA Mini Kit, and TaqMan® RT-qPCR assay was applied. Evaluation was made by comparing the RT-qPCR results with those found in the cell culture for viral isolation method. Of 616 analyzed samples, 94 (15.20%) were positive for EV RNA on the RT-qPCR assay; and in the cell culture EV was isolated from 58 (9.40 %) samples. The assay showed sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of 89.70 %, 92.40 %, 55.30 % and 98.90 %, respectively. In the present study, the RT-qPCR assay was slightly superior when compared to the viral culture technique for detecting EV from CSF samples. The TaqMan® RT-qPCR assay shows to be a fast and sensitive assay, easy to perform, and it shows a potential to improve the viral meningitis diagnosis in the public health laboratory in São Paulo State.


Assuntos
Humanos , Meningite Viral/diagnóstico , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real , Infecções por Enterovirus/diagnóstico
5.
R. Inst. Adolfo Lutz ; 75: 01-06, 2016. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-379242

RESUMO

O gênero Enterovirus (EV) é o agente etiológico mais frequente e responsável pela ocorrência de meningite viral no mundo. O objetivo deste trabalho foi de avaliar resultados da implantação do ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção de EV. Foram selecionadas 616 amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes com meningite, recebidas para realizar diagnóstico laboratorial no período de 1998-2013. Os RNAs foram extraídos diretamente do LCR pelo método QIAamp®, e o ensaio TaqMan® foi aplicado. A avaliação foi feita comparando-se resultados de RT-qPCR com os obtidos pelo método de isolamento em cultura de células. Das 616 amostras analisadas, 94 (15,2 %) foram positivas para EV no ensaio de RT-qPCR; e na cultura celular EV foi isolado de 58 (9,4 %) amostras. Valores de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo foram de 89,70 %, 92,40 %, 55,30 % e 98,90 %, respectivamente. O RT-qPCR foi ligeiramente superior à cultura viral para a detecção de EV no LCR. O RT-qPCR TaqMan® é um ensaio rápido e sensível, facilmente exeqüível e com potencial para melhorar o diagnóstico da meningite viral na rotina do laboratório de saúde pública no Estado de São Paulo.(AU)


Enterovirus (EV) genus is the most frequent etiological agent causing viral meningitis worldwide. This study aimed at evaluating the performance of real-time reverse transcription-PCR (RT-qPCR) assay for detecting EV. A total of 616 cerebrospinal fluid (CSF) samples from patients with meningitis were selected, among those received at EV diagnosis laboratory from 1998 to 2013. RNAs were directly extracted from CSF by using QIAamp® Viral RNA Mini Kit, and TaqMan® RT-qPCR assay was applied. Evaluation was made by comparing the RT-qPCR results with those found in the cell culture for viral isolation method. Of 616 analyzed samples, 94 (15.20%) were positive for EV RNA on the RT-qPCR assay; and in the cell culture EV was isolated from 58 (9.40 %) samples. The assay showed sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of 89.70 %, 92.40 %, 55.30 % and 98.90 %, respectively. In the present study, the RT-qPCR assay was slightly superior when compared to the viral culture technique for detecting EV from CSF samples. The TaqMan® RT-qPCR assay shows to be a fast and sensitive assay, easy to perform, and it shows a potential to improve the viral meningitis diagnosis in the public health laboratory in São Paulo State.(AU)


Assuntos
Humanos , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real , Meningite Viral/diagnóstico , Infecções por Enterovirus/diagnóstico
6.
Rev. paul. pediatr ; 28(1): 109-114, mar. 2010. ilus, tab
Artigo em Português | LILACS | ID: lil-552346

RESUMO

OBJETIVO: Relatar um caso de doença mão-pé-boca complicada por miosite, rabdomiólise e hepatite, interessante por ser a doença frequente em crianças e poder apresentar complicações graves, apesar de raras. DESCRIÇÃO DO CASO: Paciente de três anos de idade, sexo feminino, com história de febre por três dias, seguida pelo aparecimento de lesões ulceradas em mucosa oral e mialgia intensa. Após três dias, voltou a apresentar febre por mais dois dias (febre bifásica). Nesses dois dias, apresentou lesões eritematosas pelo corpo, principalmente nos pés, mãos e face, e procurou atendimento médico. Evoluiu com aumento de enzimas musculares e hepáticas (CPK com valor máximo de 345.007U/L, TGO 2041U/L, TGP 1589U/L, gama-GT 94U/L) e aumento transitório da creatinina sérica, com clearance de creatinina estimado pela estatura de 73mL/minuto/1,73m2 de superfície corporal. Houve melhora progressiva, com hidratação vigorosa e alcalinização da urina, sem necessidade de diálise. COMENTÁRIOS: Trata-se de uma criança com doença mão-pé-boca, com miosite, rabdomiólise e hepatite. São enfatizados os critérios clínicos laboratoriais para o diagnóstico e a importância da monitorização das complicações da doença.


OBJECTIVE: To report a hand-foot-mouth disease case, complicated by myositis, rhabdomyolisis and hepatitis, since this is a common disease in children and can result in rare but severe complications. CASE DESCRIPTION: A three-year-old girl with fever for three days, followed by the appearance of ulcerative lesions in the oral mucosa and severe muscular pain; after three days, she presented fever for two more days. At the same time, she had widespread erythematosus rash, especially in her hands, feet and face. She presented high levels of muscular and hepatic enzymes (maximum value of CPK 345.007IU/L, AST 2041IU/L, ALT 1589IU/L, GT 94IU/L), and transitory increase in serum creatinine (maximum value of 0.73mg/dL, creatinine clearance by Schwartz formula of 73mL/minute/1.73m2 of body surface). The patient improved progressively after vigorous hydration and urine alkalinization with sodium bicarbonate, without dialysis. COMMENTS: This is a case report of a child with hand-foot-mouth disease with myositis, rhabdomyolisis and hepatitis. Clinical and laboratory criteria for the diagnosis and the need to monitor complications are reviewed in this report.


Assuntos
Humanos , Feminino , Pré-Escolar , Doença de Mão, Pé e Boca/complicações , Hepatite , Injúria Renal Aguda , Miosite , Rabdomiólise
7.
Rev. cuba. med. trop ; 55(3): 133-137, sep.-dic. 2003.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-629309

RESUMO

Se describió la introducción de un método molecular para la identificación de los Enterovirus basado en la amplificación, secuenciación y análisis filogenético de la proteína VP1. Se demostró que este método reduce grandemente el tiempo requerido para la identificación de los Enterovirus aislados y resulta de gran utilidad en la caracterización de aislamientos difíciles de tipificar, con el empleo de los reactivos inmunológicos de rutina. Por la rapidez de ejecución de la técnica reviste vital importancia su uso durante epidemias, dada la rápida determinación del agente causal.


The introduction of a mollecular method to identify the Entoviruses based on the amplification, sequencing and phylogenetic analysis of protein VP1 was described. It was proved that this method reduces significantly the time required for the identification of the isolated Entoviruses and that it is very useful in the characterization of isolates which are difficult to typify by the routine immunoloigical reagents. As it is a very fast technqiue, its use is very important during epidemics to determine the causal agent rapidly.


Assuntos
Humanos , Enterovirus/genética , Enterovirus/isolamento & purificação , Proteínas Estruturais Virais/genética , Técnicas de Amplificação de Ácido Nucleico
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