RESUMO
The novel HLA-DPB1*14:01:15 allele differs from DPB1*14:01:01:01 by change of C > T in exon 3.
Assuntos
Alelos , Sequência de Bases , Éxons , Cadeias beta de HLA-DP , Teste de Histocompatibilidade , Doadores de Tecidos , Humanos , Cadeias beta de HLA-DP/genética , Brasil , Análise de Sequência de DNA/métodos , Medula Óssea , Alinhamento de Sequência , Códon , Transplante de Medula ÓsseaRESUMO
The new HLA-DRB3*03:69 allele differs from DRB3*03:01:01:03 by change of C â G in exon 3.
Assuntos
Alelos , Éxons , Cadeias HLA-DRB3 , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Teste de Histocompatibilidade , Humanos , Sequência de Bases , Códon , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Teste de Histocompatibilidade/métodos , Cadeias HLA-DRB3/genética , Alinhamento de Sequência , Análise de Sequência de DNA/métodosRESUMO
HLA-DQB1*02:211 allele differs from DQB1*02:02:01:02 by change of C â A in exon 2.
Assuntos
Alelos , Éxons , Cadeias beta de HLA-DQ , Doadores de Tecidos , Humanos , Cadeias beta de HLA-DQ/genética , Brasil , Teste de Histocompatibilidade , Transplante de Medula Óssea , Sequência de Bases , Análise de Sequência de DNA/métodos , Códon , Medula ÓsseaRESUMO
Non-classical HLA-G*01:46 differs from G*01:01:03:03 at one position in exon 3.
Assuntos
Alelos , Éxons , Antígenos HLA-G , Humanos , Antígenos HLA-G/genética , Brasil , Teste de Histocompatibilidade , Sequência de Bases , Análise de Sequência de DNA/métodosRESUMO
Protein folding and evolution are intimately linked phenomena. Here, we revisit the concept of exons as potential protein folding modules across a set of 38 abundant and conserved protein families. Taking advantage of genomic exon-intron organization and extensive protein sequence data, we explore exon boundary conservation and assess the foldon-like behavior of exons using energy landscape theoretic measurements. We found deviations in the exon size distribution from exponential decay indicating selection in evolution. We show that when taken together there is a pronounced tendency to independent foldability for segments corresponding to the more conserved exons, supporting the idea of exon-foldon correspondence. While 45% of the families follow this general trend when analyzed individually, there are some families for which other stronger functional determinants, such as preserving frustrated active sites, may be acting. We further develop a systematic partitioning of protein domains using exon boundary hotspots, showing that minimal common exons correspond with uninterrupted alpha and/or beta elements for the majority of the families but not for all of them.
Assuntos
Éxons , Dobramento de Proteína , Éxons/genética , Humanos , Proteínas/genética , Proteínas/química , Evolução Molecular , Íntrons/genéticaRESUMO
The novel HLA-C*01:273 allele, first described in a potential bone marrow donor from Brazil.
Assuntos
Alelos , Éxons , Antígenos HLA-C , Humanos , Antígenos HLA-C/genética , Brasil , Teste de Histocompatibilidade , Sequência de Bases , Doadores de Tecidos , Análise de Sequência de DNA/métodos , Alinhamento de Sequência , CódonRESUMO
Non-classical HLA-F*01:12 differs from F*01:01:01:09 at one position in exon 3.
Assuntos
Alelos , Éxons , Antígenos de Histocompatibilidade Classe I , Teste de Histocompatibilidade , Humanos , Brasil , Antígenos de Histocompatibilidade Classe I/genética , Antígenos de Histocompatibilidade Classe I/imunologia , Sequência de Bases , Análise de Sequência de DNA/métodos , Códon , Alinhamento de SequênciaRESUMO
The novel HLA-A*33:01:21 allele, first described in a potential bone marrow donor from Brazil.
Assuntos
Alelos , Éxons , Antígenos HLA-A , Humanos , Sequência de Bases , Transplante de Medula Óssea , Brasil , Teste de Histocompatibilidade , Antígenos HLA-A/genética , Análise de Sequência de DNA/métodos , Doadores de TecidosRESUMO
The novel HLA-B*18:243 allele, first described in a potential bone marrow donor from Brazil.
Assuntos
Antígeno HLA-B18 , Humanos , Alelos , Brasil , Éxons , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Teste de Histocompatibilidade/métodos , Antígeno HLA-B18/genética , Antígeno HLA-B18/imunologia , Análise de Sequência de DNA/métodos , Doadores de TecidosRESUMO
The novel HLA-DQB1*03:01:61 allele, first described in a potential bone marrow donor from Brazil.