RESUMO
Abstract TCMSP platform of systematic pharmacology of traditional Chinese medicine This study aimed to investigate the molecular mechanism of Fructus Ligustri Lucidi (NZZ, Chinese abbreviation) against osteoporosis (OP) by means of network pharmacology.ChemDraw Professional 15.1 software and Molinspiration Smiles database were used to draw the chemical formulas of the components. The active ingredients and related target proteins of NZZ were searched in platform of systematic pharmacology of traditional Chinese medicine database, Drugbank, Therapeutic Target Database, SymMap and other databases. Gene Ontology(GO) enrichment and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis were carried out on the selected target through Enrichr and KEGG Automatic Annotation databases, and their mechanism was studied. A total of 29 compounds and 140 corresponding targets, including 14 key targets and 14 protein factors in protein-protein interaction core network were obtained. The key targets were tumor necrosis factor(TNF), interleukin(IL)-6R and sestrogen receptor alpha. The number of GO items was 466 (P<0.05), including 399 items of biological process (BP), 54 items of cell composition (MF) and 13 items of molecular function (CC). KEGG pathway enrichment screened 85 signaling pathways (P<0.05), including the IL-17 signaling pathway, TNF signaling pathway, advanced glycation end products and their receptors signaling pathway and cAMP signaling pathway. The active ingredients of NZZ. exert their anti-OP effects through multi-components, multi-targets and multi-pathways, which can provide new evidence for further study of their anti-OP mechanism.
Assuntos
Osteoporose/patologia , Pesquisa/classificação , Ligustrum/efeitos adversos , Genes , Farmacologia em Rede/instrumentação , Software/classificação , Fator de Necrose Tumoral alfa/farmacologia , Produtos Finais de Glicação Avançada/efeitos adversos , Interleucina-17/análogos & derivados , Ontologia Genética , População do Leste Asiático , Medicina Tradicional ChinesaRESUMO
Abstract The present research evaluated the anti urolithic potential of Cyperus rotundus tubers extract using in silico, in vitro and in vivo techniques. In silicostudy was performed of Cyperus rotundus constituents and pathological protein oxalate oxidase (PDB Id: 2ETE). In vitrostudy, nucleation and aggregation assay involved for assessment of ethanol extract of Cyperus rotundus tuber (50-3000 µg/ml).In vivo studies involved that the Cyperus rotundusethanolic extract (100, 200 and 400 mg/kg B.wt.) wastreatedonsodium oxalate induced urolithiatic rats for seven days,evaluated kidney function by urine and serum biochemical analysis and statistical analysis performed usingGraphPad prism5 software.In silico results showedthat Cyperus rotundus constituents,Humulene epoxide, 4-Oxo-alpha-ylangene, Cubebol were exhibited better binding energyonoxalate oxidase.Ethanolic extract of Cyperus rotundustuber was exhibited nucleation, aggregation of calcium oxalate monohydrate crystals inhibition in dosedependent manner. Sodium oxalate treatment was triggered biochemical changesin the urine that have been substantially prevented by the ethanolic extract of Cyperus rotundus tuber. The current findings Cyperus rotundus anti urolithic activity due to antioxidant essential oils. The molecular docking results could be used to optimize lead and develop the appropriate urolithiasis treatment.
Assuntos
Animais , Masculino , Feminino , Ratos , Óleos Voláteis/efeitos adversos , Extratos Vegetais/análise , Cyperus/efeitos adversos , Tubérculos/classificação , Técnicas In Vitro/métodos , Software/classificação , Oxalato de Cálcio/agonistas , Urolitíase/induzido quimicamente , Id , Antioxidantes/farmacologiaRESUMO
The 24-hour Dietary Recall is considered an efficient method to collect diet data and is also widely used in population food intake monitoring. However, it requires highly qualified interviewers, which hinders its use for large samples. The objective of this study was to develop a structured and automated 24-hour Dietary Recall (R24ec) to evaluate schoolchildren and adolescent food intake, with both online and offline modes. The foods chosen for the R24ec were pre-defined from a secondary database that represents the age range of the interviewee. Using a computer, the respondents described all foods and beverages they consumed the day before the interview. The R24ec includes six pre-defined meals, incorporated in questions that contextualize the daily routines and time of consumption on the day before the interview. It also contains a list of food divided into food groups and subgroups. During the interview, non-listed items were recorded in the blanks provided for this purpose. The R24ec also includes a food photographic atlas containing different types of food; it was used as a visual aid so that the interviewees could select portion sizes. The structured 24-hour Dietary Recall was successfully developed. It is posted at the University of Sao Paulo website: www.fsp.usp.br/nutrisim.
El uso del Recordatorio de 24 horas es un buen método para recolectar datos sobre dieta y se aplica al acompañamiento alimentario de la población. Este método, sin embargo, requiere encuestadores altamente entrenados, lo que dificulta su uso en investigaciones a gran escala. El objetivo de este estudio fue elaborar un Recordatorio de 24 horas estructurado, automatizado y computarizado (R24ec) para evaluación del consumo alimentario de niños y adolescentes; el Recordatorio puede ser completado de manera online y offline Los alimentos presentes en el R24ec fueron pre-definidos a partir de una base de datos secundaria, representativa de las edades estudiadas. Los entrevistados deben describir todos los alimentos y bebidas consumidos el día anterior a la entrevista, a través del uso de una PC. El R24ec contiene seis comidas pre-definidas, incluye preguntas que contextualizan las rutinas y los lugares visitados el día anterior. Contiene, además, una lista de alimentos dividida en grupos y subgrupos alimentares. Pueden adicionarse nuevos ítems, usando el menú ?ítems no encontrados?. Se desarrolló, además, un atlas fotográfico que ilustra diferentes tipos de alimentos y que ayuda visualmente a los entrevistados a seleccionar los tamaños de las porciones ingeridas. El Recordatorio de 24 horas estructurado fue desarrollado con éxito y el mismo está hospedado en el sitio web www.fsp.usp.br/ nutrisim de la Universidade de São Paulo.
O Recordatório de 24 horas é considerado um ótimo método para coletar dados dietéticos e é muito utilizado no acompanhamento alimentar da população. Porém requer entrevistadores altamente treinados, o que dificulta o seu uso em pesquisas com grandes amostras. O objetivo deste estudo foi desenvolver um Recordatório de 24 horas estruturado e computadorizado (R24ec) de autopreenchimento para avaliação do consumo alimentar de crianças e adolescentes nos modos on-line e off-line. Os alimentos escolhidos para o R24ec foram pré-definidos a partir de um banco de dados secundário representativo para esta faixa etária. Os entrevistados devem descrever todos os alimentos e bebidas consumidos no dia anterior à entrevista através de um computador. O R24ec foi desenvolvido contendo seis refeições pré-definidas, embutidas em questões que contextualizam as rotinas e locais do dia anterior. Contém ainda uma lista de alimentos dividida em grupos alimentares e subgrupos. Durante a entrevista, itens não listados podem ser adicionados em um grupo de ?itens não encontrados?. Desenvolveu-se ainda um atlas fotográfico contendo diferentes tipos de alimentos, que serve como auxílio visual, nele os entrevistados podem selecionar tamanhos de porções. O Recordatório de 24 horas estruturado foi desenvolvido com sucesso e está hospedado no site www.fsp.usp.br/nutrisim da Universidade de São Paulo.
Assuntos
Humanos , Ingestão de Alimentos , Inquéritos Nutricionais/métodos , Software/classificaçãoRESUMO
Prior studies of multichannel ECoG from animals showed that beta and gamma oscillations carried perceptual information in both local and global spatial patterns of amplitude modulation, when the subjects were trained to discriminate conditioned stimuli (CS). Here the hypothesis was tested that similar patterns could be found in the scalp EEG human subjects trained to discriminate simultaneous visual-auditory CS. Signals were continuously recorded from 64 equispaced scalp electrodes and band-pass filtered. The Hilbert transform gave the analytic phase, which segmented the EEG into temporal frames, and the analytic amplitude, which expressed the pattern in each frame as a feature vector. Methods applied to the ECoG were adapted to the EEG for systematic search of the beta-gamma spectrum, the time period after CS onset, and the scalp surface to locate patterns that could be classified with respect to type of CS. Spatial patterns of EEG amplitude modulation were found from all subjects that could be classified with respect to stimulus combination type significantly above chance levels. The patterns were found in the beta range (15-22 Hz) but not in the gamma range. They occurred in three short bursts following CS onset. They were non-local, occupying the entire array. Our results suggest that the scalp EEG can yield information about the timing of episodically synchronized brain activity in higher cognitive function, so that future studies in brain-computer interfacing can be better focused. Our methods may be most valuable for analyzing data from dense arrays with very high spatial and temporal sampling rates.
Assuntos
Mapeamento Encefálico/métodos , Córtex Cerebral/fisiologia , Eletroencefalografia/classificação , Eletroencefalografia/métodos , Percepção/fisiologia , Sensação/fisiologia , Processamento de Sinais Assistido por Computador , Estimulação Acústica/classificação , Estimulação Acústica/métodos , Adulto , Relógios Biológicos/fisiologia , Mapeamento Encefálico/classificação , Cognição/classificação , Cognição/fisiologia , Sincronização Cortical , Aprendizagem por Discriminação/classificação , Aprendizagem por Discriminação/fisiologia , Potenciais Evocados/fisiologia , Humanos , Masculino , Reconhecimento Automatizado de Padrão , Estimulação Luminosa/métodos , Software/classificação , Software/normas , Adulto JovemRESUMO
OBJECTIVE: To present a locally developed system of computer vision for use with HRCT images, designated SIStema para a Detecção e a quantificação de Enfisema Pulmonar (SISDEP, System to Detect and Quantify Pulmonary Emphysema), and to compare this system with a freeware system tool. METHODS: Thirty-three HRCT images scanned at the apex, hilum and base of the lungs of 11 patients with COPD were analyzed. The SISDEP was compared with the Osiris Medical Imaging Software Program regarding lung parenchyma segmentation, precision of the measurement of the cross-sectional area of the lungs in mm(2), mean lung density (MLD), relative area (RA) of the lung occupied by voxels with attenuation values < -950 hounsfield units (RA -950), 15th percentile point (Perc15) and visualization of hyperinflated areas using a color mask. RESULTS: Although both computational systems were efficient in segmenting the lungs, the SISDEP performed this task automatically and more rapidly. There were significant correlations between the two systems in terms of the results obtained for lung cross-sectional area, MLD, RA -950 and Perc15 (r(2) = 0.99, 0.99, 0.99 and 1.00, respectively). The color mask tool of the SISDEP allowed excellent visualization of hyperinflated areas, discriminating them from normal areas. CONCLUSIONS: The SISDEP was efficient in segmenting the lungs and quantifying lung hyperinflation, presenting an excellent correlation with the Osiris system. The SISDEP constitutes a promising computational tool for diagnosing and assessing the progression of emphysema in HRCT images of COPD patients.
Assuntos
Doença Pulmonar Obstrutiva Crônica/diagnóstico por imagem , Enfisema Pulmonar/diagnóstico por imagem , Tomografia Computadorizada por Raios X/métodos , Idoso , Feminino , Humanos , Pulmão/diagnóstico por imagem , Masculino , Máscaras , Pessoa de Meia-Idade , Estudos Prospectivos , Software/classificação , Software/normas , Estatísticas não ParamétricasRESUMO
OBJETIVO: Apresentar um sistema de visão computacional em imagens de TCAR, desenvolvido localmente e denominado SIStema para a Detecção e a quantificação de Enfisema Pulmonar (SISDEP). Comparar esse sistema a um sistema computacional de acesso livre. MÉTODOS: Foram utilizadas 33 imagens de TCAR de 11 pacientes com DPOC com cortes tomográficos em ápice, hilo e base. O SISDEP foi comparado a Osiris Medical Imaging Software Program quanto à segmentação do parênquima pulmonar; precisão das medidas da área de secção transversal dos pulmões em mm², densidade pulmonar média (DPM), porcentagem da relative area (RA, área relativa) dos voxels com densidade < -950 unidades hounsfield (ra -950), valores de 15º percentil de baixa atenuação (perc15) e visualização das áreas hiperaeradas por máscara colorida. RESULTADOS: Os dois sistemas realizaram uma segmentação pulmonar eficiente; porém o SISDEP o fez de modo automático e mais rápido. Na comparação das medidas de área de secção dos pulmões, DPM, Perc15 e RA -950, houve alta correlação (r² = 0,99; 0,99; 0,99; e 1,00, respectivamente) entre os dois sistemas. A ferramenta de máscara colorida do SISDEP permitiu excelente visualização das áreas hiperaeradas, discriminado-as das áreas normais. CONCLUSÕES: O SISDEP se mostrou eficiente na segmentação dos pulmões e na extração de dados quantitativos da aeração pulmonar com excelente correlação com o sistema Osiris. O SISDEP constitui uma promissora ferramenta computacional para a avaliação diagnóstica e o acompanhamento da evolução do enfisema em imagens de TCAR de pacientes com DPOC.
OBJECTIVE: To present a locally developed system of computer vision for use with HRCT images, designated SIStema para a Detecção e a quantificação de Enfisema Pulmonar (SISDEP, System to Detect and Quantify Pulmonary Emphysema), and to compare this system with a freeware system tool. METHODS: Thirty-three HRCT images scanned at the apex, hilum and base of the lungs of 11 patients with COPD were analyzed. The SISDEP was compared with the Osiris Medical Imaging Software Program regarding lung parenchyma segmentation, precision of the measurement of the cross-sectional area of the lungs in mm², mean lung density (MLD), relative area (RA) of the lung occupied by voxels with attenuation values < -950 hounsfield units (ra -950), 15th percentile point (perc15) and visualization of hyperinflated areas using a color mask. RESULTS: Although both computational systems were efficient in segmenting the lungs, the SISDEP performed this task automatically and more rapidly. There were significant correlations between the two systems in terms of the results obtained for lung cross-sectional area, MLD, RA -950 and Perc15 (r² = 0.99, 0.99, 0.99 and 1.00, respectively). The color mask tool of the SISDEP allowed excellent visualization of hyperinflated areas, discriminating them from normal areas. CONCLUSIONS: The SISDEP was efficient in segmenting the lungs and quantifying lung hyperinflation, presenting an excellent correlation with the Osiris system. The SISDEP constitutes a promising computational tool for diagnosing and assessing the progression of emphysema in HRCT images of COPD patients.
Assuntos
Idoso , Feminino , Humanos , Masculino , Pessoa de Meia-Idade , Doença Pulmonar Obstrutiva Crônica , Enfisema Pulmonar , Tomografia Computadorizada por Raios X/métodos , Pulmão , Máscaras , Estudos Prospectivos , Estatísticas não Paramétricas , Software/classificação , Software/normasRESUMO
Os insetos da subfamília Phlebotominae estão entre os Diptera de interesse médico e sua importância deve-se à presença de espécies vetoras de doenças como as Leishmanioses. Existem cerca de 900 espécies descritas, sendo que mais da metade ocorre nas Américas. No Estado de São Paulo, ocorrem aproximadamente 66 espécies, incluindo os principais vetores de Leishmaniose Tegumentar Americana Nyssomyia intermedia, N. neivai, N. whitmani e da Leishmaniose Visceral Americana Lutzomyia longipalpis. Os objetivos deste trabalho foram: construir uma chave de identificação ilustrada para as espécies de flebotomíneos do Estado de São Paulo, produzir um software de identificação interativa, e, ampliar e sistematizar os conhecimentos relativos à distribuição geográfica da fauna flebotomínea. Os espécimes incluídos nesse estudo foram obtidos por empréstimo das coleções do Museu de Zoologia da USPe da Faculdade de Saúde Pública/USP e estão montados em lâminas permanentes de microscópio. A identificação em nível de gênero, subgênero e espécie foi feita através de descrições e chave taxonômica de Galati (1995). Uma chave de identificação ilustrada para 66 machos e 55 fêmeas foi produzida a partir da observação de caracteres relacionados principalmente à genitálias, cibário da fêmea e coloração do tórax. Também foi produzida uma chave de identificação interativa através do sistema DELTA. O trabalho inclui 223 desenhos a traço.
Assuntos
Dípteros , Leishmaniose , Psychodidae/classificação , Software/classificaçãoRESUMO
Os insetos da subfamília Phlebotominae estão entre os Diptera de interesse médico e sua importância deve-se à presença de espécies vetoras de doenças como as Leishmanioses. Existem cerca de 900 espécies descritas, sendo que mais da metade ocorre nas Américas. No Estado de São Paulo, ocorrem aproximadamente 66 espécies, incluindo os principais vetores de Leishmaniose Tegumentar Americana Nyssomyia intermedia, N. neivai, N. whitmani e da Leishmaniose Visceral Americana Lutzomyia longipalpis. Os objetivos deste trabalho foram: construir uma chave de identificação ilustrada para as espécies de flebotomíneos do Estado de São Paulo, produzir um software de identificação interativa, e, ampliar e sistematizar os conhecimentos relativos à distribuição geográfica da fauna flebotomínea. Os espécimes incluídos nesse estudo foram obtidos por empréstimo das coleções do Museu de Zoologia da USPe da Faculdade de Saúde Pública/USP e estão montados em lâminas permanentes de microscópio. A identificação em nível de gênero, subgênero e espécie foi feita através de descrições e chave taxonômica de Galati (1995). Uma chave de identificação ilustrada para 66 machos e 55 fêmeas foi produzida a partir da observação de caracteres relacionados principalmente à genitálias, cibário da fêmea e coloração do tórax. Também foi produzida uma chave de identificação interativa através do sistema DELTA. O trabalho inclui 223 desenhos a traço.
Assuntos
Dípteros , Leishmaniose , Psychodidae/classificação , Software/classificaçãoRESUMO
El poroósitso de este trabajo, es presentar un software de gestión, y administración de datos e imágenes, adaptado especialmente para ortodoncia y cirugía ortognática, de facil utilización