RESUMO
Spirochetal bacteria were successfully isolated from mosquitoes (Culex pipiens, Aedes cinereus) in the Czech Republic between 1999 and 2002. Preliminary 16S rRNA phylogenetic sequence analysis showed that these strains differed significantly from other spirochetal genera within the family Spirochaetaceae and suggested a novel bacterial genus in this family. To obtain more comprehensive genomic information of these isolates, we used Illumina MiSeq and Oxford Nanopore technologies to sequence four genomes of these spirochetes (BR151, BR149, BR193, BR208). The overall size of the genomes varied between 1.68 and 1.78 Mb; the GC content ranged from 38.5 to 45.8%. Draft genomes were compared to 36 publicly available genomes encompassing eight genera from the class Spirochaetes. A phylogeny generated from orthologous genes across all taxa and the percentage of conserved proteins (POCP) confirmed the genus status of these novel spirochetes. The genus Entomospira gen. nov. is proposed with BR151 selected as type species of the genus. For this isolate and the closest related isolate, BR149, we propose the species name Entomospira culicis sp. nov. The two other isolates BR208 and BR193 are named Entomospira nematocera sp. nov. (BR208) and Entomospira entomophilus sp. nov. (BR193). Finally, we discuss their interesting phylogenetic positioning.
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Spirochaetales/classificação , Spirochaetales/genética , Spirochaetales/isolamento & purificação , Animais , Artrópodes/genética , Técnicas de Tipagem Bacteriana/métodos , Composição de Bases/genética , DNA Bacteriano/genética , Filogenia , RNA Ribossômico 16S/genética , Análise de Sequência de DNA/métodos , Spirochaeta/genéticaRESUMO
In recent years, biofuels have attracted great interest as a source of renewable energy owing to the growing global demand for energy, the dependence on fossil fuels, limited natural resources and environmental pollution. However, the cost-effective production of biofuels from plant biomass is still a challenge. In this context, the study of carbohydrate-binding modules (CBMs), which are involved in guiding the catalytic domains of glycoside hydrolases to polysaccharides, is crucial for enzyme development. Aiming at the structural and functional characterization of novel CBMs involved in plant polysaccharide deconstruction, an analysis of the CAZy database was performed and CBM family 64 was chosen owing to its capacity to bind with high specificity to microcrystalline cellulose and to the fact that is found in thermophilic microorganisms. In this communication, the CBM-encoding module named StX was expressed, purified and crystallized, and X-ray diffraction data were collected from native and derivatized crystals to 1.8 and 2.0â Å resolution, respectively. The crystals, which were obtained by the hanging-drop vapour-diffusion method, belonged to space group P3121, with unit-cell parameters a = b = 43.42, c = 100.96â Å for the native form. The phases were found using the single-wavelength anomalous diffraction method.
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Proteínas de Bactérias/química , Spirochaeta/química , Proteínas de Bactérias/genética , Proteínas de Bactérias/isolamento & purificação , Sítios de Ligação , Clonagem Molecular , Cristalização , Cristalografia por Raios X , Spirochaeta/genéticaRESUMO
We describe stromatolites forming at an altitude of 3570 m at the shore of a volcanic lake Socompa, Argentinean Andes. The water at the site of stromatolites formation is alkaline, hypersaline, rich in inorganic nutrients, very rich in arsenic, and warm (20-24°C) due to a hydrothermal input. The stromatolites do not lithify, but form broad, rounded and low-domed bioherms dominated by diatom frustules and aragonite micro-crystals agglutinated by extracellular substances. In comparison to other modern stromatolites, they harbour an atypical microbial community characterized by highly abundant representatives of Deinococcus-Thermus, Rhodobacteraceae, Desulfobacterales and Spirochaetes. Additionally, a high proportion of the sequences that could not be classified at phylum level showed less than 80% identity to the best hit in the NCBI database, suggesting the presence of novel distant lineages. The primary production in the stromatolites is generally high and likely dominated by Microcoleus sp. Through negative phototaxis, the location of these cyanobacteria in the stromatolites is controlled by UV light, which greatly influences their photosynthetic activity. Diatoms, dominated by Amphora sp., are abundant in the anoxic, sulfidic and essentially dark parts of the stromatolites. Although their origin in the stromatolites is unclear, they are possibly an important source of anaerobically degraded organic matter that induces in situ aragonite precipitation. To the best of our knowledge, this is so far the highest altitude with documented actively forming stromatolites. Their generally rich, diverse and to a large extent novel microbial community likely harbours valuable genetic and proteomic reserves, and thus deserves active protection. Furthermore, since the stromatolites flourish in an environment characterized by a multitude of extremes, including high exposure to UV radiation, they can be an excellent model system for studying microbial adaptations under conditions that, at least in part, resemble those during the early phase of life evolution on Earth.
Assuntos
Cianobactérias/genética , Diatomáceas/genética , Sedimentos Geológicos/microbiologia , Lagos/microbiologia , Rhodobacteraceae/genética , Spirochaeta/genética , Adaptação Fisiológica , Altitude , Arsênio/análise , Sequência de Bases , Evolução Biológica , Cianobactérias/classificação , Cianobactérias/isolamento & purificação , DNA Bacteriano/classificação , DNA Bacteriano/genética , Diatomáceas/classificação , Diatomáceas/isolamento & purificação , Ecossistema , Sedimentos Geológicos/química , Lagos/química , Dados de Sequência Molecular , Filogenia , Rhodobacteraceae/classificação , Rhodobacteraceae/isolamento & purificação , Salinidade , Spirochaeta/classificação , Spirochaeta/isolamento & purificação , Temperatura , Raios UltravioletaRESUMO
Relata-se inusitado achado de micro-organismos, semelhantes às espiroquetas, móveis e de diferentes morfologias e tamanhos, identificados pela microscopia de campo escuro, no sangue de animais do Centro de Bioterismo da Faculdade de Medicina da USP. As bactérias não crescem em meios habituais de cultivo, são pouco coradas pelo Giemsa e derivados da prata, e as provas sorológicas e moleculares foram negativas para Borrelia e Leptospira. A microscopia eletrônica revelou presença de micro-organismos com morfologia de Mycoplasma e, devido à sua mobilidade, sugeriu-se a presença de Mollicutes do gênero Spiroplasma. Visualizaram-se micro-organismos com mesmas características em 15 dos 26 funcionários (57,6 por cento) do Centro de Bioterismo da FMUSP; contudo, exames clínicos e laboratoriais indicaram que os indivíduos estavam saudáveis. Estudos adicionais desenvolvidos na Disciplina de Reumatologia da FMUSP mostraram que, aproximadamente, 94 por cento dos pacientes com Síndrome Baggio-Yoshinari (SBY) e 20 por cento dos indivíduos normais também exibiam as mesmas estruturas identificadas no Centro de Bioterismo. A microscopia eletrônica realizada com amostras de pacientes com SBY mostrou bactérias que apresentam semelhanças com Mycoplasma, Chlamydia e Bacteroides. Visto que as sorologias e os testes moleculares foram negativos para estes contaminantes e com base em publicações da literatura médica, sugeriu-se que estes agentes infecciosos latentes fossem bactérias na sua apresentação L, que são definidas como bactérias despojadas de parede celular, assumindo, assim, morfologia de Mycoplasma, sendo, na maioria dos casos, inofensivas aos hospedeiros. Concluímos que os "espiroquetídeos" visualizados em animais e funcionários do Centro de Bioterismo seriam bactérias na forma L, não patogênicas, provenientes de contaminantes do meio ambiente, infecções regulares habituais ou oriundos de micro-organismos endógenos da flora saprofítica normal. Ao contrário, os...
We report the unusual finding of mobile spirochetal microorganisms with different morphologies and sizes, on dark-field microscopy of the blood of animals from the Vivarium of the Medical School of USP. The bacteria did not grow in common culture media, shows faint staining to Giemsa and silver-derived stains, and serologies and molecular tests were negative for Borrelia and Leptospira. Electron microscopy revealed the presence of microorganisms with Mycoplasma-like morphology and, due to its mobility, it was suggested that they represented Mollicutes of the genus Spiroplasma. Microorganisms with the same morphology were also observed in 15 out of 26 employees (57.6 percent) of the Vivarium of FMUSP; however, clinical and laboratorial exams indicated that those individuals were healthy. Additional studies undertaken at the Rheumatology Department of FMUSP demonstrated the presence of the same structures identified at the Vivarium in approximately 94 percent of the patients with Baggio-Yoshinary syndrome (BYS) and 20 percent of healthy individuals. Electron microscopy of the blood of BYS patients showed bacteria that shared similarities with Mycoplasma, Chlamydia, and Bacteroides. Since serologies and molecular tests were negative for those contaminants, and based on publications in the medical literature, it was suggested that those latent infectious agents were L-form bacteria, defined as cell wall deficient bacteria, assuming, therefore, Mycoplasma morphology and they are, for the most part, harmless to the host. We concluded that spirochetal microorganisms visualized in animals and employees of the Vivarium were non-pathogenic L-form bacteria from contaminants in the environment, regular infections, or endogenous microorganism from the normal saprophytic flora. On the other hand, spirochetal organisms identified in BYS, by preserving the capacity to invade cells in vitro, are potentially pathogenic and related to the etiology of BYS. We consider BYS as a ...
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Humanos , Animais , Masculino , Feminino , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Experimentação Animal , Técnicos em Manejo de Animais , Doença de Lyme , Neuroborreliose de Lyme , Infecções por Mycoplasma , Spirochaeta , Infecções por Spirochaetales , Infestações por Carrapato , Doenças Transmitidas por Carrapatos , ZoonosesRESUMO
Soros de aves experimentalmente infectadas, contendo espiroquetas viáveis, foram submetidos a dois procedimentos antes da criopreservaçäo: glicerol na diluiçäo de 1/2 (v/v), designado como soro com glicerol a 50 por cento (GS), e dimetilsulfóxido na proporçäo de 1/10 (v/v), designado como soro com DMSO a 10 por cento (DS). Após 15 meses de estocagem em nitrogênio líquido, amostras dos tratamentos GS e DS foram descongeladas e suas infectividades foram testadas em frangos susceptíveis. Apesar de ambos os procedimentos terem mantidos a infectividade da bactéria, DMSO a 10 por cento no soro de frango apresentou-se mais satisfatório como criopreservante
Assuntos
Animais , Infecções por Borrelia , Criopreservação , Aves Domésticas , SpirochaetaRESUMO
O artigo tem por objetivo apresentar as manifestações cutâneas da síndrome da doença de Lyme-símile no Brasil, que revela aspectos histopatológicos em comum com inúmeras doenças difusas do tecido conjuntivo. Os autores relatam o primeiro caso de paniculite lobular associado à borreliose no país e comentam a evolução sorológica sequencial e tratamento desta entidade clínica
Assuntos
Humanos , Masculino , Criança , Borrelia burgdorferi , Doença de Lyme/complicações , Doença de Lyme/diagnóstico , Doença de Lyme/etiologia , Doença de Lyme/terapia , Paniculite , SpirochaetaRESUMO
A doença periodontal é induzida principalmente por microorganismos anaeróbicos. A importância de anaeróbios na iniciação e progressão da periodontite tem-se tornado evidente devido aos métodos de analises em microbiologia. Estes anaeróbicos e outras bactérias são usualmente diminuidos pela instração mecânica. Entretanto, existem limitações quanto a eficiência da raspagem e alisamento radicular em controlar os patógenos em bolsas profundas, concavidade radiculares, furcas ou em situações de invasão bacteriana nos tecidos. Assim, a terapêutica periodontal com o emprego de metronidazol, uma droga específica para anaeróbios, tem demonstrado eficiência na diminuição da enfermidade periodontal, associado a raspagem e alisamento radicular