ANÁLISIS COMPUTACIONAL DEL EFECTO DE POLIMORFISMOS DE GENES DEL SISTEMA μ-CALPAÍNA/CALPASTATINA SOBRE LA CALIDAD DE LA CARNE BOVINA / COMPUTATIONAL ANALYSIS OF POLYMORPHISMS IN GENES OF THE μ-CALPAIN/CALPASTATIN SYSTEM IN BOVINE MEAT QUALITY
Rev. med. vet. zoot
; 62(1): 50-66, ene.-abr. 2015. ilus, tab
Article
em Es
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LILACS-Express
| LILACS
| ID: lil-755633
Biblioteca responsável:
CO332
RESUMEN
Los genes del sistema de enzimas μ-Calpaína/Calpastatina han sido ampliamente evaluados en estudios de asociación respecto de parámetros de calidad cárnica como la terneza; previamente se han identificado varios polimorfismos asociados con la variación fenotípica en poblaciones no relacionadas de bovinos. Usando herramientas computacionales se logró postular la asociación de cuatro polimorfismos encontrados en μ-Calpaína y 11 en Calpastatina que producen una alteración de los parámetros físico-químicos, tanto del ARNm (estabilidad y polimorfismo conformacional), como de la proteína (punto isoeléctrico, potencial electroestático y superficie molecular). Es importante poder establecer el soporte biológico de polimorfismos genéticos asociados con parámetros fenotípicos que mejoren la productividad animal, lo que hace que la aproximación in silico se convierta en una herramienta útil para tal fin.
ABSTRACT
μ-Calpain/Calpastatin enzymatic system are extensively evaluated in tenderness association studies of beef quality and several polymorphisms of these same genes have been reported previously associated with phenotypic variation in non-related bovine populations. Computational tools were used to screen four polymorphisms in μ-Calpain gene and 11 in Calpastatin gene that can alter the physical and mRNA chemical properties (stability and conformational polymorphism) and its respective proteins (isoelectric point, electrostatic potential and molecular surface) of polymorphisms previously reported in public databases. In silico aproximation is a useful tool in phenotype-genotype association studies because can provide a biological support to this type of animal production traits.
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1
Coleções:
01-internacional
Base de dados:
LILACS
Idioma:
Es
Revista:
Rev. med. vet. zoot
Assunto da revista:
MEDICINA VETERINARIA
Ano de publicação:
2015
Tipo de documento:
Article
País de afiliação:
Colômbia
País de publicação:
Colômbia