Fangorn Forest (F2): a machine learning approach to classify genes and genera in the family Geminiviridae.

Silva, José Cleydson F; Carvalho, Thales F M; Fontes, Elizabeth P B; Cerqueira, Fabio R

Silva, José Cleydson F; Carvalho, Thales F M; Fontes, Elizabeth P B; Cerqueira, Fabio R.

Afiliação

Silva JCF; Department of Informatics, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, Minas Gerais, 36570-900, Brazil.
Carvalho TFM; Department of Biochemistry and Molecular Biology, Universidade Federal de Viçosa, Campus Universitário, Viçosa, Minas Gerais, 36570-900, Brazil.
Fontes EPB; Department of Informatics, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, Minas Gerais, 36570-900, Brazil.
Cerqueira FR; National Institute of Science and Technology in Plant-Pest Interactions/BIOAGRO, Campus Universitário, Viçosa, Minas Gerais, 36570-900, Brazil. bbfontes@ufv.br.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 431, 2017 Sep 30.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28964254

Assuntos

Geminiviridae/genética; Aprendizado de Máquina; Área Sob a Curva; DNA Satélite/classificação; DNA Satélite/genética; Geminiviridae/classificação; Internet; Fases de Leitura Aberta/genética; Plantas/virologia; Curva ROC; Interface Usuário-Computador

Palavras-chave

Geminivirus; machine learning; Gene classification; Genus classification; Multilayer perceptron; Random Forest; Support vector machines

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Geminiviridae / Aprendizado de Máquina Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Reino Unido

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